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OTU microbioma qiime2 NGS webapp

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camz
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Inserito il - 12 maggio 2023 : 19:19:57

E' disponibile la webapp su http://www.microbioma16s.it per l'analisi user-friendly ed interattiva dei dati da sequenziamento NGS di metabarcoding del gene per rRNA 16S, relativi al microbioma batterico, su un'unica piattaforma che esegue una pipeline basata sul pacchetto di analisi qiime2 (www.qiime.org). La webapp è disponibile anche da tablet e smartphone. Permette sia l'analisi secondaria dei dati grezzi (file fastq.gz da sequenziamento Illumina), che l'analisi terziaria di tabelle di OTU e tassonomia ed eventuali metadati associati ai campioni, per ottenere in modo semplice e intuitivo i risultati di alfa e beta diversità e di abbondanze relative dei taxa.

camz
Nuovo Arrivato

2 Messaggi

Inserito il - 12 maggio 2023 : 19:23:06

La webapp è scritta in inglese e in italiano!