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Robru87
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Inserito il - 20 marzo 2008 : 14:55:50  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Robru87 Invia a Robru87 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
é stato fatto un incrocio tra un Hfr arg+ bio+ leu+ e un f- arg-bio-leu-.Esperimenti in laboratorio di accoppiamento interrotto mostrano che arg+ entra per ultimo e quindi i ricombinanti arg+ vengono selezionati su terreno che contiene solo biotina e leucina.Questi ricombinanti vengono poi analizzati per la presenza di bio+ e leu+.Per ciascun genetipo vengono contati i seguenti individui:
arg+ bio+ leu+ 320
arg+ bio+ leu- 8
arg+ bio- leu+ 0
arg+ bio- leu- 48
Qual è l'ordine dei geni?
Quali sono le distanze di mappa in unità di ricombinazione?

hurricane86
Nuovo Arrivato



50 Messaggi

Inserito il - 20 marzo 2008 : 19:37:22  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di hurricane86 Invia a hurricane86 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
devi calcolare la percentuale di volte che i geni segregano assieme, più è alta più sono vicini.

Think I'll lose my mind if I don't find something to pacify

....muore lentamente chi non esplora cio che non conosce....
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hurricane86
Nuovo Arrivato



50 Messaggi

Inserito il - 20 marzo 2008 : 19:40:01  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di hurricane86 Invia a hurricane86 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
per l'ordine dei geni, dato che sono solo tre fai presto, cerchi il doppio crossingover, (quello con il numero più basso)
in questo caso bio è in mezzo, infatti perchè cambi solo lui sono necessari ben quattro crossingover, ed è dura!

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ilarip
Utente Junior

haci

Prov.: Bologna
Città: Bologna


432 Messaggi

Inserito il - 20 marzo 2008 : 19:40:02  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di ilarip  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di ilarip Invia a ilarip un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciaooo
se usi la funzione cerca de forum ne trovi alcuni ex simile di genetica già svolti

Ho imparato.. .che le opportunità non vanno mai perse.
Quelle che lasci andare tu...le prende qualcun altro
Ho imparato...che è meglio dare consigli solo in due circostanze...
Quando sono richiesti e quando ne dipende la vita.


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hurricane86
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50 Messaggi

Inserito il - 20 marzo 2008 : 19:43:30  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di hurricane86 Invia a hurricane86 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ah mi è venuto un dubbio sul fatto che siano davvero quattro i CO o solo due, mi ricordo qualcosa riguardo al fatto che il plasmide rimaneva aperto ed erano danni seri.....

correggetemi se è errato

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Robru87
Nuovo Arrivato



9 Messaggi

Inserito il - 20 marzo 2008 : 19:46:46  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Robru87 Invia a Robru87 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da hurricane86

per l'ordine dei geni, dato che sono solo tre fai presto, cerchi il doppio crossingover, (quello con il numero più basso)
in questo caso bio è in mezzo, infatti perchè cambi solo lui sono necessari ben quattro crossingover, ed è dura!

quindi nn mi puoi aiutare?
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hurricane86
Nuovo Arrivato



50 Messaggi

Inserito il - 20 marzo 2008 : 20:55:53  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di hurricane86 Invia a hurricane86 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
la risposta che ti ho dato sul calcolo della percentuale casi non assieme/totale è giusta,(cioè la percentuale di scambio)
come calcolare l'ordine anche (il prima già lo sai, quello in mezzo è quello che da solo cambia di meno, il terzo per esclusione)
il problema era un dubbio sul numero dei crossingover,
se hai un plasmide tondo con un DNA circolare anch'esso sappi che devono essere sempre pari, quindi con CO come nel tuo caso arg bio leu che cambia quello in mezzo sono quattro, se è lineare solo due

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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


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Inserito il - 21 marzo 2008 : 18:57:03  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da Robru87

siccome si tratta di 1 coniugazione tra un hfr e un f- vorrei sapere se il meccanismo è uguale a quello degli eucarioti o se c'è qualcosa ke cambia... qui il dna è circolare... poi x sapere l'ordine devo considerare il numero degli ex coniuganti?



Allora innanzitutto ti consiglio di leggerti questo PDF per un po' di teoria: Genetica Batteri
dove è spiegato tutto sicuramente meglio di come potremmo fare nel forum, alle pag. 12-16 trovi la parte che ti interessa.

Comunque tu hai un "incrocio" tra un HFR (cioè ha F integrato nel cromosoma batterico, non il plasmide F a parte) e F- (cioè non possiede F).
Il trasferimento (come vedrai meglio dal pdf) avviene da HFR a F- in modo che si trasferisca un DNA "lineare", a questo punto il DNA "lineare" o viene integrato nel genoma del batterio ricevente o viene perso (il DNA "lineare" viene eliminato).
Affinché venga integrato è necessario come diceva hurricane86 che avvengano 2 C.O. (se fosse solo 1 il cromosoma batterico rimarrebbe aperto e sarebbe degradato).
Immagina quindi di avere un frammento lineare di questo tipo:

arg+    bio+    leu+
====================

in base al punto in cui avvengono i due C.O. si potranno integrare i vari geni e il pezzo di DNA lineare che non viene integrato (punti esterni al C.O.) viene perso.
Sai già che arg+ entra per ultimo perché viene detto:
Citazione:
Messaggio inserito da Robru87
Esperimenti in laboratorio di accoppiamento interrotto mostrano che arg+ entra per ultimo ...

Quindi ti resta da stabilire chi tra bio+ e leu+ è in mezzo.
Affinché vengano integrati solo i due geni esterni dovresti avere 4 C.O., come ha detto anche hurricane86, questo è un fenomeno più raro e quindi sarà quello con la frequenza minore.
arg+ bio- leu+ 0
allora bio+ è in mezzo!
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Robru87
Nuovo Arrivato



9 Messaggi

Inserito il - 21 marzo 2008 : 19:03:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Robru87 Invia a Robru87 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
quindi l'ordine sarebbe leu+ bio+ arg+?
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8398 Messaggi

Inserito il - 21 marzo 2008 : 19:22:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Si esatto!

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Robru87
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9 Messaggi

Inserito il - 21 marzo 2008 : 19:29:16  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Robru87 Invia a Robru87 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ora invece x calcolare le distanze devo vedere esattamente cosa dai dati ke ho?
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8398 Messaggi

Inserito il - 21 marzo 2008 : 20:00:34  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Allora per calcolare le distanze (come aveva già detto anche hurricane86) non fai altro che fare il rapporto tra geni non assieme/totale.
Tu hai:
arg+ bio+ leu+ 320 --> non c'è ricombinazione
arg+ bio+ leu- 8
arg+ bio- leu+ 0
arg+ bio- leu- 48
Totale = 376

arg+ bio+ leu- 8 --> qua hai solo arg+ bio+ quindi è avvenuta la ricombinazione tra bio e leu

calcoli quindi la distanza tra bio e leu:
8/376 x 100 = 2,13% = 2,13 unità di ricombinazione

arg+ bio- leu- 48 --> qua hai solo arg+ quindi è avvenuta la ricombinazione tra arg e bio

calcoli quindi la distanza tra arg e bio:
48/376 x 100 = 12,76% = 12,76 unità di ricombinazione


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Robru87
Nuovo Arrivato



9 Messaggi

Inserito il - 21 marzo 2008 : 20:17:06  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Robru87 Invia a Robru87 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
sei un mito grazie
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