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Autore

Discussione

cin
Utente Junior

Prov.: Padova
Citt�: Padova

558 Messaggi

Inserito il - 27 novembre 2008 : 14:34:42

Era questo che volevo farvi vedere e di cui molti sapranno gi� dell'esistenza, andando in NCBI, sotto UNIGENE, metto il nome del mio gene, quando si apre la pagina clicco sul mio gene in azzurrino-grigetto e quando si apre la pagina vado in basso su EXPRESSION PROFILE, otterr� ad esempio questo:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/UniGene/ESTProfileViewer.cgi?uglist=Hs.73793
Spero di essere stata chiara e utile a qualcuno...

P.S.
non so se � il posto giusto per postarlo.

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Citt�: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 27 novembre 2008 : 14:40:21

Molto interessante, pero' bisogna ricordare che quei livelli di espressione sono calcolati solo tramite allineamenti di ESTs, mentre adesso vi sono tecniche piu' sofisticate per predirre la stessa cosa, come SAGE, microarrays, etc.

Un altro tool simile, che e' integrato con un database di microarray (credo) e' il gene sorter di UCSC.
Esempio:
- http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgNear?hgsid=116568609&org=Human&db=hg18&near_search=VEGFA&submit=Go!&near_order=expGnfAtlas2&near.count=50

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)

cin
Utente Junior

Prov.: Padova
Citt�: Padova

558 Messaggi

Inserito il - 27 novembre 2008 : 14:53:56

Oh mio Dio.....c'� un mondo abnorme di informazioni l� dentro!