Forum

Nome Utente:
Password:
Riconoscimi automaticamente
 Tutti i Forum
 Laboratorio
 Genetica
 aiutatemi
 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
I seguenti utenti stanno leggendo questo Forum Qui c'è:

Aggiungi Tag Aggiungi i tag

Quanto è utile/interessante questa discussione:

Autore Discussione  

fio
Nuovo Arrivato



6 Messaggi

Inserito il - 02 dicembre 2004 : 15:09:03  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di fio Invia a fio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Come si fa ad individuare un gene e la sua funzione conoscendo la sua posizione approssimativa?

fio
Nuovo Arrivato



6 Messaggi

Inserito il - 02 dicembre 2004 : 16:21:13  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di fio Invia a fio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
non lo so
Torna all'inizio della Pagina

atreliu
Amministratore

2970fired

Prov.: Milano
Città: Milano


2484 Messaggi

Inserito il - 03 dicembre 2004 : 06:16:44  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di atreliu  Invia a atreliu un messaggio AOL  Invia a atreliu un messaggio ICQ  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di atreliu  Invia a atreliu un messaggio Yahoo! Invia a atreliu un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Bhè, se la sua funzione è già nota è molto semplice.
Basta andare su un Browser genomico come http://www.ensembl.org/ e cercare...
Trovi su questo sito
http://www.molecularlab.it/bioinformatica/browser_genomici.asp
una breve guida/spiegazione.

Riky

MolecularLab.it - Animazioni, News, didattica & Community su bioinformatica, biologia molecolare ed ingegneria genetica.

BUONE REGOLE DEL FORUM:
- Prima di postare qualunque cosa leggere il Regolamento!
- Hai provato a cercare prima di postare il tuo problema?
Torna all'inizio della Pagina

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 03 dicembre 2004 : 07:57:27  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Vorrei ricordare anche NCBI: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?CMD=search&DB=genome

Se ci dai qualche "estremo" possiamo anche darti una mano a fare la ricerca, potrebbe non essere semplicissimo!

nICO

Sei un nuovo arrivato?
Leggi il regolamento del forum e presentati qui

My photo portfolio (now on G+!)
Torna all'inizio della Pagina

Ra1D
Utente Junior

giro-Ra1D

Prov.: Bergamo
Città: Treviglio


174 Messaggi

Inserito il - 04 dicembre 2004 : 12:29:29  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Ra1D Invia a Ra1D un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ma cosa intendi per "conoscendo la sua posizione approssimativa?"
Perchè se intendi dire che conosci una sequenza nucleotidica in cui è probabile ci sia il tuo gene, allora devi ricercare una ORF, ad esempio con l'ORF finder di NCBI:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html

Per la funzione invece è già più complicato, però puoi ricorrere a ricerca in banca dati con Fasta o Blast....(è meglio prima tradurre il tuo gene e poi ricercare proteine omologhe).
Ciao

Simo

...e vicinissimo al mio sapere si accampa la tenebra della mia ignoranza...
Torna all'inizio della Pagina

fio
Nuovo Arrivato



6 Messaggi

Inserito il - 06 dicembre 2004 : 17:53:28  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di fio Invia a fio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da chick80

Vorrei ricordare anche NCBI: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?CMD=search&DB=genome

Se ci dai qualche "estremo" possiamo anche darti una mano a fare la ricerca, potrebbe non essere semplicissimo!

nICO

Torna all'inizio della Pagina

fio
Nuovo Arrivato



6 Messaggi

Inserito il - 06 dicembre 2004 : 17:55:56  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di fio Invia a fio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
dobbiamo clonare un gene per la statira, sensibile al dosaggio, localizzato nelle 3 Mb distali del braccio lungo del cromosoma 15.
Torna all'inizio della Pagina

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 06 dicembre 2004 : 19:10:39  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Scusa, in che senso "sensibile al dosaggio"?
Se avete un'idea di che gene potrebbe essere e avete un modello cellulare o meglio animale potreste valutare se con dei trattamenti l'espressione di questo gene varia (banalmente con PCR), anche se non so che trattamenti si potrebbero fare nel vostro caso specifico...
Questo gene, poi, dove dovrebbe essere attivo (intendo in che tessuti)? Si potrebbe fare un'analisi delle proteine espresse in quel tessuto es. con 2D SDS-PAGE e vedere i differenti pattern tra differenti individui...
Inoltre, se il gene è stato localizzato lì si dovrebbe sapere almeno qualcosa dalla letteratura, bisogna andare x ipotesi!

nICO

Sei un nuovo arrivato?
Leggi il regolamento del forum e presentati qui

My photo portfolio (now on G+!)
Torna all'inizio della Pagina

fio
Nuovo Arrivato



6 Messaggi

Inserito il - 06 dicembre 2004 : 21:40:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di fio Invia a fio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao,
sensibile al dosaggio nel senso che la sua presenza in singola copia (monosomia) o tripla (trisomia) causano alterazioni fenotipiche rispetto ad un individuo normale (disomico biparentale).
Il gene che dobbiamo trovare è responsabile della statura e si trova sulla zona distale del braccio lungo del cromosoma 15. Abbiamo individuato IGF-1R (Insuline-Like Growth Factor Receptor).
Vorremmo sapere quale la procedura per la sua corretta individuazione e clonaggio.
Grazie! Ciao
Torna all'inizio della Pagina

dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi

Inserito il - 11 dicembre 2004 : 19:26:03  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao!
non ho capito: in pratica voi sapete che il gene che volete studiare si trova nella regione distale del braccio lungo del cromosoma 15, però vorreste sapere esattamente quali sono le basi da cui è composto, dove si trova esattamente?
E' una bella domanda di genomica :). Quali strumenti avete a disposizione? come avete individuato IGF-1R?


cioè tu sai che in quella regione del cromosoma 15 c'è una alterazione che può portare a difetti nell'altezza (quale organismo?).
Come hai fatto a saperlo? come fai a sapere che si tratti di un singolo gene?

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
Torna all'inizio della Pagina

AleXo
Moderatore

OrniAle

Prov.: Estero
Città: San Francisco, California


1550 Messaggi

Inserito il - 15 dicembre 2004 : 21:32:32  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di AleXo  Invia a AleXo un messaggio AOL Invia a AleXo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
così su due piedi,per sfruttare la vaga indicazione sulla posizione, mi farei un giro sul genome browser dell'UCSC(università della california-Santa Cruz).

Torna all'inizio della Pagina

AleXo
Moderatore

OrniAle

Prov.: Estero
Città: San Francisco, California


1550 Messaggi

Inserito il - 16 dicembre 2004 : 12:49:29  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di AleXo  Invia a AleXo un messaggio AOL Invia a AleXo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
http://genome.ucsc.edu/

Torna all'inizio della Pagina
  Discussione  

Quanto è utile/interessante questa discussione:

 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
Vai a:
MolecularLab.it © 2003-18 MolecularLab.it Torna all'inizio della Pagina