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Tag   OTU    microbioma    rRNA  Aggiungi Tag

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ariStat
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1 Messaggi

Inserito il - 07 maggio 2021 : 11:44:14  Mostra Profilo Invia a ariStat un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Buongiorno a tutt@!
sono una studentessa di statistica e per scrivere la mia tesi di laurea, sto guardando diversi dataset relativamente al microbioma. Premetto che sono un'ignorante in materia!
Ho trovato spesso dataset contenenti come variabili OTU seguito da un numero: sono numeri relativi molto piccoli. Mi sapete spiegare cosa sono? Io avrei bisogno di frequenze assolute (quindi conteggi) di questi geni (?). Sapete se è possibile?
Ad esempio, in un dataset: ci sono in totale 45 OTU ed ho notato che la somma per riga mi da un valore pari a (circa 1).
Grazie

Giuliano652
Moderatore

profilo

Prov.: Brescia


6925 Messaggi

Inserito il - 08 maggio 2021 : 09:08:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Giuliano652 Invia a Giuliano652 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Operational Taxonomy Unit, è un modo per distinguere le specie viventi
https://en.wikipedia.org/wiki/Operational_taxonomic_unit
https://drive5.com/usearch/manual7/otu_definition.html

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