Un genoma da 1000 dollari

Per ora il costo del sequenziamento è sceso da 20 a 2 milioni di dollari

L’ipotetico prezzo da pagare per ottenere la sequenza del proprio genoma personale è ormai calato dalla proibitiva cifra di 20 milioni di dollari a quella più “abbordabile” di circa 2,2 milioni: l’obiettivo è quello di ridurre ulteriormente il costo fino a un migliaio di dollari, in modo da rendere possibili prevenzioni e trattamenti su misura per il singolo paziente.
Il calo è stato possibile grazie a una nuova tecnologia di sequenziamento del DNA, sviluppata dai ricercatori dell’Harvard Medical School Jay Shendure, Gregory Porreca, George Church e colleghi e descritta online il 4 agosto sulla rivista “Science”.

Gli autori hanno sequenziato il genoma del batterio E. coli a una frazione del costo delle tecniche convenzionali, usando strumenti di laboratorio e reagenti chimici. Il metodo sembra ancora più preciso e meno costoso di alcune tecnologie attualmente in commercio.
La tecnica si basa sulla conversione di un microscopio relativamente economico, dotato di una camera digitale da usare in un processo di sequenziamento rapido e automatico che non richiede elettroforesi, un processo lento ma fondamentale per il metodo convenzionale di Sanger. La nuova tecnica innesca la replicazione di migliaia di frammenti di DNA attaccati a una perlina di un micron, producendo una maggior densità del segnale in un’area piccola ma abbastanza grande da essere risolta con ottiche poco costose. Quattro tinture fluorescenti, corrispondente alle quattro basi del DNA, si legano alle specifiche locazioni della sequenza genetica a seconda di quale base è presente. Il frammento brilla poi con uno dei quattro colori, rivelando l’identità della base. La videocamera registra i colori, documenta i risultati e invia i dati ai computer che li reinterpretano come una sequenza lineare di coppie di basi.

Fonte: (29/08/2005)
Pubblicato in Biotecnologie
Tag: sequenziamento, genoma

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