Ottimizzare l'analisi del genoma del mais

Circa l80 per cento del DNA contiene sequenze ripetitive o identiche

Come minuscole isolette circondate da un vasto oceano, i gruppi di geni nel mais sono separati da larghe regioni di DNA altamente ripetitive ed estremamente faticose da decifrare. Questa complessa struttura ha notevolmente complicato i tentativi di sequenziare il genoma del mais, una delle coltivazioni più importanti del pianeta.
Nel tentativo di ottimizzare le tecniche per sequenziare il DNA di queste isolette ricche di geni, alcuni scienziati del The Institute for Genomic Research (TIGR) hanno scoperto che l'unione di due diversi approcci per identificare le regioni del genoma non ripetitive può rappresentare un'alternativa complementare ed economica al sequenziamento dell'intero genoma delle piante complesse.
In un articolo pubblicato sul numero del 19 dicembre della rivista "Science", i ricercatori spiegano che le due tecniche indipendenti - il filtraggio della metilazione e la selezione del C0t - hanno come obiettivo regioni del genoma distinte ma sovrapposte, e pertanto possono essere usate insieme per giungere all'identificazione di quasi tutti i geni del mais e della loro struttura genomica.
La scoperta è importante, in quanto il genoma del mais, che comprende circa 2,5 miliardi di coppie di basi del DNA, è quasi venti volte più grande di quello della prima pianta ad essere stata decifrata, l'Arabidopsis thaliana, e quasi sei volte quello del riso.

Queste enormi dimensioni sono dovute al fatto che approssimativamente l'80 per cento consiste di famiglie di sequenze ripetute quasi identiche. Le sequenze che contengono i geni sono concentrate nel restante 20 per cento del genoma.

Fonte: (21/12/2003)
Pubblicato in Biotecnologie

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