Decodificato il genoma di HIV-1

Per la prima volta è disponibile un modello completo della struttura secondaria dei filamenti di RNA che costituiscono il genoma del virus

I ricercatori dell'Università della North Carolina a Chapel Hill sono riusciti a decodificare, per la prima volta, la struttura completa del genoma dell'HIV-1, ottenendo così risultati che potranno avere ruolo determinante nella comprensione delle strategie d'infezione che il virus attua nei confronti dell'ospite umano, come auspica Kevin Weeks, docente di chimica dell'UNC che ha guidato lo studio e ha firmato l'articolo pubblicato sull'ultimo numero della rivista Nature.
L'HIV-1 è un retrovirus il cui genoma è formato da due copie di singoli filamenti di RNA, che contano 10.000 nucleotidi, in grado di ripiegarsi per formare complesse strutture tridimensionali.

Finora, spiega nell'articolo Weeks, la modellizzazione del genoma si limitava a piccole parti di RNA, ma il nuovo lavoro ha portato i ricercatori ad analizzare e codificare l'intero genoma proveniente da colture virali del National Cancer Institute.
I risultati indicano che la struttura dell'RNA influenzi in diversi stadi il ciclo infettivo dell'HIV.
Swanstrom conclude "Un primo approccio potrebbe consistere nel cambiare la sequenza nucleotidica e vedere che cosa succede, se per esempio tale intervento porta a danneggiare il virus, si potrebbe concludere che in quel locus specifico è presente qualcosa di importante"

[Architecture and secondary structure of an entire HIV-1 RNA genome
Joseph M. Watts, Kristen K. Dang, Robert J. Gorelick, Christopher W. Leonard, Julian W. Bess Jr, Ronald Swanstrom, Christina L. Burch & Kevin M. Weeks
Nature, vol. 460 (2009), n. 7256, p. 711-716]

Redazione (07/10/2009)
Pubblicato in Genetica, Biologia Molecolare e Microbiologia
Tag: HIV, genoma

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