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laura85
Nuovo Arrivato

106 Messaggi |
Inserito il - 20 gennaio 2007 : 18:25:15
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ciao ragazzi!! sto studiando la real time pcr ma sono usciti dei nomi che proprio non capisco e non so cosa sono...vi chiedo quindi un aiuto!!! sybr green sybr gold yo yo e yo pro...sono ds dna-biding agent giusto? che si intercalano nel dna ed emettono fluorescenza per visualizzare il prodotto di amplificato che sto ottenendo giusto?? ma sono in pratica sonde?? MOlecular Beacons e Scorpions sono dei tipi di sonde fluorescenti..sapreste dirmi come funzionano??? grazie
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chick80
Moderatore
    

Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 20 gennaio 2007 : 21:31:28
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Sybr green, sybr gold e yo-pro sono intercalanti del DNA, tipo l'etidio bromuro. Non sono sonde nel senso che non hanno specificità per una certa sequenza, ma per tutto il DNA ds. Non conosco yo yo ma penso sia tipo lo yo pro.
I molecular beacon sono sonde fatte in modo da ottenere una struttura ad hairpin. Con la struttura ad hairpin non fluorescono perchè il fluoroforo è vicino ad un quencher. Quando si legano al DNA durante l'amplificazione invece, l'hairpin si apre e il quencher si allontana dal fluoroforo. Vedi http://www.molecular-beacons.org/Introduction.html
Gli scorpions sono molto simili, ma contengono uno dei primers. vedi http://www.gene-quantification.de/chemistry.html#scorpions |
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laura85
Nuovo Arrivato

106 Messaggi |
Inserito il - 21 gennaio 2007 : 19:10:46
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grazie mille!! corro subito a vedere i link |
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laura85
Nuovo Arrivato

106 Messaggi |
Inserito il - 21 gennaio 2007 : 19:41:32
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posso dire che sei un grande?? e tutti quelli che qua rispondono sono dei grandi..il forum è bellissimo e utilissimo GRAZIE perchè lo avete creato e continuate a lavorarci sopra |
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