software predizione epitopi antigenici B e T

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dom
Nuovo Arrivato

13 Messaggi

Inserito il - 21 maggio 2013 : 12:38:05

Buongiorno a tutti.
Qualcuno saprebbe, per favore, indicarmi degli ottimi software (eventualmente anche a pagamento) che permettano di predire gli epitopi antigenici B e T di una data sequenza amminoacidica?
(Al momento ne sono riuscita a trovare alcuni tra cui http://tools.immuneepitope.org/main/html/tcell_tools.html.)
Grazie.
dom

kORdA
Utente Attivo

Prov.: Milano
Citt�: Monza

1303 Messaggi

Inserito il - 21 maggio 2013 : 13:44:47

Usare lo IEDB mi sembra un buon punto di partenza. Spulciando nel mio Mendeley ho trovato questi articoli se pu� interessare (poi dipende da cosa intendi tu per "ottimi"):

Citazione:
Bublil EM, Proteins. 2007 Jul 1;68(1):294-304. PMID: 17427229.
Schreiber A, J Comput Chem. 2005 Jul 15;26(9):879-87. PMID: 15834923.
Mayrose I, Nucleic Acids Res. 2007;35(1):69-78. PMID: 17151070

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada

dom
Nuovo Arrivato

13 Messaggi

Inserito il - 22 maggio 2013 : 08:49:09

Grazie mille per le tue indicazioni; sono state molto utili.
dom

kORdA
Utente Attivo

Prov.: Milano
Citt�: Monza

1303 Messaggi

Inserito il - 22 maggio 2013 : 17:02:55

Dimenticavo, c'� anche questa review uscita da poco su PLoS ONE:

Citazione:
Yao B, PLoS One. 2013 Apr 19;8(4):e62249. PMID: 23620816

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada

AleXo
Moderatore

Prov.: Estero
Citt�: San Francisco, California

1550 Messaggi

Inserito il - 22 maggio 2013 : 18:57:33

nice review, thanks!

kORdA
Utente Attivo

Prov.: Milano
Citt�: Monza

1303 Messaggi

Inserito il - 23 maggio 2013 : 08:58:20

sipper� non citano il tool del nostro lab, siamo degli illustri sconusciuti

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada

dom
Nuovo Arrivato

13 Messaggi

Inserito il - 24 maggio 2013 : 12:15:52

Gentilissimo. Grazie ancora.
dom

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