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midichloria
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75 Messaggi |
Inserito il - 15 gennaio 2014 : 16:02:28
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Ciao a tutti! Sto cercando di studiare la spettrometria di massa, in particolare al momento sono alle prese con l'ESI. Non riesco proprio a capire i grafici e il discorso degli ioni monocarica ecc ecc. Per esempio guardando questo grafico http://www.chimicamo.org/wp-content/uploads/2012/11/pentane_edited1.gif io cosa ne posso dedurre?? Inoltre quando analizzo una proteina con la metodica ESI.... la mia proteina rimane intera o viene spezzettata? E in cosa viene spezzettata? Nei suoi aminoacidi? In ioni tipo C, O, N?????? Non riesco proprio a capirci nulla!!!!!!!!
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AntonioSillo
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61 Messaggi |
Inserito il - 18 gennaio 2014 : 17:47:22
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ciao midichloria! allora lo spettro che si apre in quel link mi sembra più uno spettro ES che ESI. in ogni caso quando il pentano viene colpito dagli elettroni ad alta energia cinetica, produce quel pattern di frammentazione, nel senso che si rompe in tanti pezzi. il più abbondante è lo ione a m/z 40. probabilmente perché lo ione propil è il più stabile in fase gassosa. poi ci sono altre specie che invece si trovano a m/z distribuite intorno al picco base dello ione propilico.
Per quanto riguarda le proteine, bisogna utilizzare una sorgente di ionizzazione più blanda come l'ESI. la frammentazione o no della proteina dipende dalla modalità, nel senso che se ti interessa sapere solo il 'peso' della proteina puoi semplicemente nebulizzarla e fare uno spettro MS1 della proteina, altrimenti se vuoi la struttura primaria, allora una volta nebulizzata e ionizzata, la proteina la fai collidere cn un gas ad una energia tale da rompere la proteina solo in corrispondenza degli aminoacidi facendo così uno spettro MS2
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midichloria
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75 Messaggi |
Inserito il - 20 gennaio 2014 : 10:18:35
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Grazie mille!!!!!!! :D |
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