io ho ristretto del dna fagico con enzimi di restrizione e dopo corsa elettroforetica su gel di agarosio 1% con un marker ad alto peso molecolare (Hind III), voglio calcolarmi il peso molecolare delle bande. ma come fare? qulacuno di voi sa come fare?
Ovviamente se non hai la sequenza delle basi ti dovrai accontentare di qualcosa tipo: PM = [(Ax312.2) + (Gx328.2) + (Cx288.2) + (Tx303.2) - 61.0] PM = 307.7 * numero di basi (307.7 e' la media dei pesi della formula sopra)
Se vuoi sapere il peso (prima di far correre il gel) fai una lettura a 260 e hai 1 OD260 = 33ug DNAss 1 OD260 = 50ug DNAds
il fatto č che nn si conosce la sequenza e quindi nn so la quantita di a g c t. io pensavo di calcolarmi la distanza delle bande del marker dal pozzetto e farmi un grafico e poi tramite una retta di regressione calcolarmi i pesi delle bande di restrizione calcolando la distanza dal pozzetto.