Se hai un inserto blunt e un plasmide blunt (vale lo stesso se hai tagliato con lo stesso enzima di restrizione da ambo i lati) la ligation può avvenire sia così:
---plasmide---3'| |5'AAA---inserto---CCC3'| |5'---plasmide
---plasmide---5'| |3'TTT---inserto---GGG5'| |3'---plasmide
che così:
---plasmide---3'| |5'GGG---inserto---TTT3'| |5'---plasmide
---plasmide---5'| |3'CCC---inserto---AAA5'| |3'---plasmide
cioè con l'inserto rovesciato. Quando invece tagli con enzimi diversi:
---plasmide---3'| |5'AAA---inserto---3'| |5'CCC---plasmide
---plasmide------TTT5'| |3'---inserto---GGG5'| |3'---plasmide
E l'inserto non può capovolgersi, perchè non appaia più...
(non so se sono stato chiaro con questi disegni rudimentali )
Citazione:
Gli enzimi che mi portano alla ligation quali sono?