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giulix
Nuovo Arrivato
5 Messaggi |
 Inserito il - 15 luglio 2005 : 22:12:52
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Ciao a tutti
qualcuno di voi si intende della tecnica di affymetrix?
Non riesco a capire come a partire da aree separate di oligonucleotidi identici si possa poi arrivare ad avere la sequenza complementere delcRNA.
Se qualche biotecnologolo sa......
CIAOOO
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jenny83
Nuovo Arrivato
9 Messaggi |
 Inserito il - 09 settembre 2007 : 12:03:37
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| Volevo chiedere la stessa cosa...nn c'è nessuno che mi può spiegare come funziona qst tecnica? |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
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biologomolecolare84
Nuovo Arrivato
Prov.: Rm
Città: Roma
69 Messaggi |
Inserito il - 14 marzo 2009 : 18:25:28
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Ciao a tutti
la mia dmnd è più teorica che pratica dato che sto preparando l'esame di bionformatica e non mi serve per un lavoro in lab. mi sono bloccato nel modello Affymetrix del calcolo della Background correction. Nelle diapositive del prof compare una formula del genere:
A(x,y) = max(I(x,y) – b(x,y),0.5*n(x,y))
che riesco proprio ad interpretare. A lezione lui ha detto che più il rumore è vicino alla mia fixture, più avrà un peso (che va da 1 a 0) nella sottrazione. Il suo esempio è stato:
"se ho la fixture vicinissima (coincidente con il 2% dei dati a minor intensità) il peso sarà 1, questo significa che il rumore che state sottraendo è esattamente uguale al valore di quel 2%, quindi immaginate che il vostro 2% sia 2...quindi 2X1(peso)=2 e se il vostro segnale è 10, allora 10-2=8"
quello che non riesco a capire è il collegamento tra questo risultato (8) e la formula che ci ha dato...cosa può significare quella virgola tra il termine b(x,y) e 0.5*n(x,y))?
Grazie mille anticipatamente della vostra disponilità
Ciauz!!! |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 14 marzo 2009 : 18:38:35
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| Guarda, non conosco quella formula, ma immagino che intenda che devi prendere l, b e n (che non so cosa siano...) per lo spot di coordinate x,y |
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biologomolecolare84
Nuovo Arrivato
Prov.: Rm
Città: Roma
69 Messaggi |
Inserito il - 14 marzo 2009 : 20:37:05
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| si avevo immaginato...ma vedi non trovo corrispondenza tra i calcoli che ha fatto lui e la formula...boh!!!Grazie cmq... |
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