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mattia.dinunzio
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Inserito il - 01 dicembre 2008 : 14:46:12  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di mattia.dinunzio Invia a mattia.dinunzio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao ragazzi vi chiedo un parere. Per caso è possibile fare una analisi statistica di significativita tipo il t-test quando il controllo non ha dev.st.? questo perche il controllo avra sempre arbitrariamente il valore 100% in ogni esperimento. ciao

chick80
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DNA

Città: Edinburgh


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Inserito il - 01 dicembre 2008 : 15:57:02  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Potresti fare due o tre replicati del controllo in modo che il controllo avrebbe una dev. std. (anche se poi poni la media dei replicati a 100%)

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mattia.dinunzio
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Inserito il - 01 dicembre 2008 : 16:34:40  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di mattia.dinunzio Invia a mattia.dinunzio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Certo, potrei mediare le ds di ogni replica biologica del controllo...che dite?
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 01 dicembre 2008 : 17:47:05  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Beh, ma scusa, non puoi mediare tutti il controllo e chiamare 100% la media dei controlli invece del singolo controllo?

Ad es.


Exp 1.
ctrl = 10
c1   = 15
c2   = 14

Exp 2
ctrl = 10.5
c1   = 20
c2   = 15

Exp 3
ctrl = 9
c1   = 13
c2   = 18


Fai la media dei 3 controlli che viene 9.83 e riferisci tutti i valori a questo (100%)

i controlli saranno quindi
10/9.83 = 101.7%
10.5/9.83 = 106.8%
9/9.84 = 91.5%

Facendo la media ottieni - come giusto che sia - 100% (sd = 7.77%)

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mattia.dinunzio
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Inserito il - 03 dicembre 2008 : 08:59:42  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di mattia.dinunzio Invia a mattia.dinunzio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Intanto grazie per il disturbo che ti stai prendendo. le cose non sono cosi semplici in quanto il valore del controllo nei vari exp indipendenti puo varia di molto anche se il rapporto tra il controllo e le condizioni sperimentali sono sempre le stesse. sotto l'esempio.
EXP 1:
ctrl: 100
x:200
y:300

EXP 2:
ctrl: 200
x:400
y:600

come vedi le condizioni sperimentali x e y sono sempre il doppio e triplo del controllo rispettivamente con una ds, in questo caso ipotetico, inesistente. Ma la ds del cntl invece sara altissima. Questa variabilità del valore assoluto dei dati dipende dalle efficienze dei vari passaggi, che siano reazioni di transfezione, elisa o altro. te allora come faresti???
ciao
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 03 dicembre 2008 : 13:07:46  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ho capito... e in ciascun singolo esperimento hai solo 1 controllo o hai replicati?

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mattia.dinunzio
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Inserito il - 03 dicembre 2008 : 15:23:15  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di mattia.dinunzio Invia a mattia.dinunzio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
generalmente dei doppi
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


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Inserito il - 03 dicembre 2008 : 15:38:56  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Beh, quindi potresti fare la media dei due controlli.

Ad es.

EXP 1:
ctrl: 100, 101
x:200, 205
y:300, 295

EXP 2:
ctrl: 200, 195
x:400, 410
y:600, 580


Nel primo exp la media sarà 100.5 e quindi avrai i due controlli come 100.5% e 99.5%, la cui media fa 100%.
Nel secondo exp avrai media 197.5 e quindi saranno 101.2% e 98.8%

Quindi nel complesso i controlli saranno (100.5+99.5+101.2+98.8)/4 = 100% con dev std = 1.06
Poi puoi procedere con un ANOVA.

Se non puoi fare così allora credo che l'unica soluzione sia avere tutti i controlli come 100% e quindi dev std = 0.

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mattia.dinunzio
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Inserito il - 03 dicembre 2008 : 15:42:51  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di mattia.dinunzio Invia a mattia.dinunzio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
si ha senso
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mattia.dinunzio
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Inserito il - 03 dicembre 2008 : 16:16:53  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di mattia.dinunzio Invia a mattia.dinunzio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie mille
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


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Inserito il - 03 dicembre 2008 : 16:41:03  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
di niente

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