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iacko
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10 Messaggi

Inserito il - 25 settembre 2009 : 15:31:27  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di iacko Invia a iacko un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti, mi č venuto un dubbio che forse qualcuno di voi potrā risolvere: Perchč intercalanti come l'etidio bromuro sono in grado di emettere maggiormente fluorescenza quando incorporati nella doppia elica????Grazie a tutti,ciao ciao

Iacko

Garzgul
Utente Junior

Prov.: Roma
Cittā: Roma


183 Messaggi

Inserito il - 25 settembre 2009 : 16:59:56  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Garzgul  Invia a Garzgul un messaggio Yahoo! Invia a Garzgul un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao, la tua domanda mi ha incuriosito ma ho trovato solo questo su wikipedia in inglese, alla voce ethidium bromide:

As with most fluorescent compounds, ethidium bromide is aromatic. Its core heterocyclic moiety is generically known as a phenanthridine, an isomer of which is the fluorescent dye acridine.

The reason for ethidium bromide's intense fluorescence after binding with DNA is probably not due to rigid stabilization of the phenyl moiety, because the phenyl ring has been shown to project outside the intercalated bases. In fact, the phenyl group is found to be almost perpendicular to the plane of the ring system, as it rotates about its single bond to find a position where it will abut the ring system minimally. Instead, the hydrophobic environment found between the base pairs is believed to be responsible. By moving into this hydrophobic environment and away from the solvent, the ethidium cation is forced to shed any water molecules that were associated with it. As water is a highly efficient fluorescent quencher, the removal of these water molecules allows the ethidium to fluoresce.

Riassunto in italiano, non č il gruppo fenile, dato che si sistema all'esterno rispetto alle basi ma piuttosto l'ambiente idrofobico che si trova tra le coppie di basi pare essere il responsabile. Intercalandosi tra le basi, il catione etidio č costretto a liberarsi delle molecole d'acqua a cui era legato; essendo l'acqua un buon attenuatore della fluorescenza, una volta rimosse le molecole d'acqua, la fluorescenza aumenta.
Spero di averti aiutato e di non aver detto castronerie!
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iacko
Nuovo Arrivato




10 Messaggi

Inserito il - 29 settembre 2009 : 17:47:41  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di iacko Invia a iacko un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie mille!!! avevo cercato un sacco e non l'avevo trovato.... Mi sei stato utilissimo.
Ciao ciao

Iacko
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