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Pipps
Utente Junior



244 Messaggi

Inserito il - 24 marzo 2016 : 11:11:31  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Pipps Invia a Pipps un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Buongiorno, da poco sto provando dei sequenziamenti manuali con metodo di Sanger per coding strand di alcuni promotori. Utilizzo un protocollo modificato che prevede una prima PCR 25X (uso la Vent-exo-DNA Pol), un secondo step di precipitazione in etanolo e risposensione e una seconda PCR con primer marcato per il singolo filamento e ddNTPs. Il problema che si è verificato è che il pattern di amplificazione è uguale per tutte e 4 le basi e non riesco a discriminarle. Ho provato introducendo lo step di precipitazione in etanolo, e per un paio di geni la cosa ha funzionato, ma cambiando gene da analizzare il problema si è ripresentato. Idee? Consigli? grazie.
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