Salve, non riesco bene a capire come si costruiscono le sonde che andranno ad ibridare il DNA frammentato; come si arriva a comprendere la disposizione dei siti di restrizione con l'utilizzo di sonde all'interno di un genoma? In base alla corsa elettroforetica dei marcatori di peso molecolare si possono calcolare le dimensioni dei frammenti che andranno ad ibridare con la sonda e dalle dimensioni dei frammenti si puň arrivare a costruire la mappa di restrizione, ma come si calcolano effettivamente, potete farmi un esempio pratico? grazie.
Come si calcolano effettivamente, intendi, come fanno a formulare un primer che abbia una sequenza esattamente complementare a quella della regione bersaglio?
Immagino che per poter fare Biologia Molecolare su una qualsiasi regione di DNA, bisogni sapere la sua composizione in bp - e quindi sia necessaria una qualche strategia preventiva di sequenziamento.
E' il drawback di tutte le tecniche d'ibridazione - l'ibridazione ti permette d'essere specifico e preciso, ma se non conosci la sequenza, la specificitŕ viene meno.