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laurina
Nuovo Arrivato
61 Messaggi |
 Inserito il - 11 aprile 2013 : 22:42:06
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Buonasera a tutti....
questa sera ho un'altra cosa da chiedervi,spero possiate aiutarmi.
Una volta definito in che cosa consiste la MS e aver parlato delle principali tecniche di ionizzazione, su degli appunti che ho recuperato, viene posta questa domanda?
" come passo dal rapporto massa/carica alla massa?"
dice di considerare un caso di protonazione di un peptide intero.
ma non capisco..... Sapreste spiegarmi in cosa consiste il passaggio?
grazie mille a tutti!
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Patrizio
Moderatore
Città: Barcellona
1914 Messaggi |
 Inserito il - 12 aprile 2013 : 07:09:45
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moltiplicare la carica per il rapporto massa/carica?
non ho capito bene cosa vuoi dire con considerare un caso di protonazione di un peptide intero, in genere la massa che si perde o si acquista con i protoni non viene considerata, o meglio viene considerata nel margine di errore |
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laurina
Nuovo Arrivato
61 Messaggi |
Inserito il - 12 aprile 2013 : 08:52:07
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Buongiorno!
Ti scrivo pari pari quello che che c'è scritto sull'appunto.
io non capisco, ma magari tu puoi illuminarmi la giornata!
"come passo dal rapporto massa/carica alla massa?
consideriamo il caso di protonazione di un peptide intero.
il peptide che acquista più protoni avrà il maggior numero di cariche, perciò il minor rapporto massa/carica.
es: P= m/z = 2001 --> m= 2001 x z ; z= 5
m= 2001 x 5= 10005
Mr= 10005 - 5= 10000
p= m/z --> m= Mr + z
p= Mr + z/ z (z=protoni che si sono legati)
Due picchi vicini sidifferianziano di una unità di carica; se guardo due picchi vicini, quello a sx ha un protone in più di quello di dx.
p1= 2001
p2=2501
p1= Mr+z1/z1= 2001
p2= Mr(z1-1)/(z1-1)= 2501
Mr= 2001 x z1 -z1
Mr= 2501(z1-1) - (z1-1)
2001 x z1 - z1= 2501(z1-1) - (z1-1)
z1=4,998 (circa 5)
Mr= ( 2001 x 5 ) - 5=10000
Perciò, con lo spettrometro di massa, possiamo parlare di masse e non di rapporto massa/carica."
Allora....mi rendo conto che sembra che io abbia dato i numeri, ma purtroppo non capisco cosa devo fare! 
Grazie mille
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Patrizio
Moderatore
Città: Barcellona
1914 Messaggi |
Inserito il - 18 aprile 2013 : 08:18:58
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Premetto che nella pratica credo che sia molto difficile che ti ritrovi a fare questi conti, tuttavia cos'è che non ti torna? stai cercando il valore Mr= il valore medio della massa della tua proteina o peptide in questo caso e credo che quello che c'era da fare in questo caso sia stato fatto
Io non sono espertissimo di questa parte teorica, ma magari ci arriviamo insieme,
sai cosa sono Mr, Z1 a -1 ? |
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ramaya86
Nuovo Arrivato
46 Messaggi |
Inserito il - 15 ottobre 2014 : 18:39:28
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Ciao a tutti! ho un problema: se ho una proteina di membrana che ho mutato in un singolo amminoacido la tecnica per essere sicura della avvenuta mutazione è fare una spettrometria di massa! ma quale è meglio considerando che la mia proteina deve essere mantenuta a T basse altrimenti si sfascia?
un LC MS/MS andrebbe bene? Magari una sorgente Maldi, sicuramente non sorgente ESI perché la mia proteina per rimanere in soluzione ha bisogno del detergente e ciò è incompatibile con l'ESI. Forse un Maldi con analizzatore a tempo di volo?. Potete aiutarmi? |
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