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giggino
Nuovo Arrivato



25 Messaggi

Inserito il - 30 dicembre 2008 : 11:56:41  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di giggino Invia a giggino un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Cos'è l'Alanine-scanning??

Luis 22
Utente

Baricalcio

Città: Bari


755 Messaggi

Inserito il - 30 dicembre 2008 : 17:44:14  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Luis 22  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Luis 22  Invia a Luis 22 un messaggio Yahoo! Invia a Luis 22 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Non ne avevo mai sentito parlare, ma leggendo questo abstract (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15340171), mi pare di capire che si effettua una analisi della sequenza amminoacidica di una proteina per individuare certi residui (Alanina appunto) che si trovano preferenzialmente in certe conformazioni secondarie (Ala nell'alfa-elica) e comprendere come eventuali modifiche alternino tali conformazioni e ovviamente la funzione.



La vita e i sogni sono fogli di uno stesso libro. Leggerli in ordine è vivere, sfogliarli a caso è sognare. (Arthur Schopenhauer)&
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AleXo
Moderatore

OrniAle

Prov.: Estero
Città: San Francisco, California


1550 Messaggi

Inserito il - 30 dicembre 2008 : 18:11:36  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di AleXo  Invia a AleXo un messaggio AOL Invia a AleXo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
L'alanin scanning è una simpaticissima tecnica di protein engineering (utilizzando site directed mutagenesis) che consiste nel modificare in sequenza i residui (uno alla volta o procedendo per piccole sequenze, e.g.5aa di fila) che si presumono coinvolti in una determinata attività o struttura di una proteina (e.g. gli amminoacidi del sito catalitico di un enzima o come citato prima in un elica, ma teoricamente si può fare lo scanning dell'intera proteina) in alanina, che viene considerato un aa solitamente non coinvolto in nessun ruolo "attivo"(mi spiace non so spiegarmi meglio). Dalla caratterizzazione dei mutanti si può dedurre così il contributo del/i residuo/i modificato/i.

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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 31 dicembre 2008 : 09:42:39  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
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