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alexct82
Nuovo Arrivato

Prov.: ct
Città: catania
26 Messaggi |
Inserito il - 06 marzo 2009 : 15:57:13
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Ciao a tutti. Qualcuno potrebbe suggerirmi un protocollo per estrarre l'RNA da tessuti in paraffina? In laboratorio abbiamo il trizol e un Kit per estrarre il DNA con le colonnine della quiagen (non so se si può usare anche per estrarre l'RNA, se tratto con DNase..).. Grazie a chiunque potrà aiutarmi.
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GFPina
Moderatore
    

Città: Milano
8408 Messaggi |
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cin
Utente Junior


Prov.: Padova
Città: Padova
558 Messaggi |
Inserito il - 06 marzo 2009 : 16:37:04
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Ricorda che la cosa più importante è cosa ci devi fare poi con quest'RNA. |
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elisabetta strafella
Nuovo Arrivato
18 Messaggi |
Inserito il - 13 marzo 2009 : 18:07:04
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Ciao estrarre RNA da tessuto in paraffina è abbastanz difficile perchè devi eliminare la paraffina con un apposito protocollo ossia vari passaggi in xilolo ed etanolo,omogenizzare il tessuto e usare colonnine apposite per RNA. La paraffina crea dei legami ss con il materiale nucleare per cui quando si deparaffina l' RNA si rompe quindi dovresti provare a vedere che cosa riesci a recuperare, Fammi sapere ciao |
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283
Nuovo Arrivato
115 Messaggi |
Inserito il - 16 maggio 2012 : 10:19:27
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a tal proposito..qualcuno sa se si può estrarre rna da tessuti fissati in PFA? |
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biotool
Nuovo Arrivato
97 Messaggi |
Inserito il - 24 maggio 2012 : 00:26:42
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confermo la difficolta' di ottenere RNA in quantita' e qualita' sufficiente per poter fare succesivamente ad esempio una PCR. Un kit specifico a tale scopo: RNeasy FFPE Kit della qiagen con il suo protocollo. |
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Berkana
Nuovo Arrivato
Città: Perugia
1 Messaggi |
Inserito il - 27 agosto 2013 : 13:17:33
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Buongiorno a tutti, attualmente sto utilizzando il kit qiagen rneasy ffpe con alcune modifiche nel protocollo e devo dire che per quanto riguarda la purezza dell'rna ricavato si ottengono ottimi risultati. Per quanto riguarda la qualità invece ci sono ancora un pò di difficoltà perchè l' Rna è molto degradato , la retrotrascizione riesce usando superscript + esarandom ma in PCR successivamente si riescono ad amplificare solo frammenti corti, max 150 bp... C'è qualcuno che ha esperienza di questo kit e riesce ad amplificare frammenti almeno di 300bp? Grazie mille per l'attenzione :) |
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