Credo (ma non prenderla come verità assoluta, potrei sbagliarmi e non sono un esperto in merito) che MALDI-MS sia semplicemente più generale, con un qualsiasi strumento di MS usato come detector. La MALDI-TOF invece usa uno strumento MS-TOF.
Il Maldi TOF se ricordo bene è una versione piu efficiente del maldi . TOF sta per TIME OF FLIGHT .. Lo strumento serve a fare in modo che ioni che hanno la stessa dimensione ma rapporto massa/carica diverso possano giungere al detector nello stesso momento . Tutto questo si fa perchè lo strumento potrebbe "ingannare" i risultati,cioè far arrivare al detector in tempi diversi due ioni della stessa dimensione e far supporre che invece siano differenti tra loro . Il maldi ms dovrebbe essere la versione semplice , relazionata allo spettrometro di massa