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 concentrazione del GEL per elettroforesi
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°silvia°
Nuovo Arrivato


Prov.: Genova
Città: genova


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Inserito il - 23 ottobre 2006 : 09:30:11  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di °silvia° Invia a °silvia° un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao...

Di gel ne ho fatti parecchi però sempre sotto indicazioni di altri
"ne voglio uno all'11, uno al 12 e bla bla bla" ma non ho ancora ben capito che concentrazioni uso per separare una det. proteina.

In base al peso molecolare aumento o diminuisco la concentrazione ma c'è una tabella che mi dica i valori della concentrazione per peso di proteina?

Lo stesso discorso vale per i Gel a DNA.
Concentrazione diversa a seconda del genoma...


consigli? grazie

°silvia°
Nuovo Arrivato


Prov.: Genova
Città: genova


100 Messaggi

Inserito il - 23 ottobre 2006 : 09:33:11  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di °silvia° Invia a °silvia° un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Scusaaaate! ho sbagliato sezione! qualcuno può spostarmi nelle tecniche? grazie!

(e magari eliminare questo secondo messaggio)

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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 23 ottobre 2006 : 11:53:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao Silvia,
io intanto ti rispondo qui!

Tieni sempre presente questo: se aumenti la concentrazione le maglie del gel sono più strette e quindi i frammenti più grandi fanno più fatica a passare (migrano più lentamente!).

Detto questo si capisce perchè per visualizzare meglio bande piccole utilizzi gel a concentrazioni maggiori (se la concentrazione è inferiore le bande più piccole possono anche migrare fuori dal gel!) mentre per visualizzare bande a PM superiore usi gel a concentrazioni basse (altrimenti non migrano ma rimangono tutte all'inizio del gel!)

Questo è un esempio per quanto riguarda i gel di agarosio per il DNA:

% Agarosio -- bp DNA

0,3% ------ 60.000 - 5.000
0,6% ------ 20.000 - 1.000
0,7% ------ 10.000 - 800
0,9% ------ 7.000 - 500
1,2% ------ 6.000 - 400
1,5% ------ 4.000 - 200
2,0% ------ 3.000 - 100



Questa invece è un'immagine di gel di poliacrylamide a diverse concentrazioni:

Immagine:

14,73 KB


Silvia
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atreliu
Amministratore

2970fired

Prov.: Milano
Città: Milano


2484 Messaggi

Inserito il - 23 ottobre 2006 : 12:53:12  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di atreliu  Invia a atreliu un messaggio AOL  Invia a atreliu un messaggio ICQ  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di atreliu  Invia a atreliu un messaggio Yahoo! Invia a atreliu un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
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Bel contributo Silvia (e bellissime le img)

Riccardo

MolecularLab.it - Animazioni, News, didattica & Community su bioinformatica, biologia molecolare ed ingegneria genetica.

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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 23 ottobre 2006 : 18:58:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da atreliu

Discussione spostata.
Bel contributo Silvia (e bellissime le img)

Riccardo



Dici a me Riki?... Grazie
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°silvia°
Nuovo Arrivato


Prov.: Genova
Città: genova


100 Messaggi

Inserito il - 23 ottobre 2006 : 21:05:15  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di °silvia° Invia a °silvia° un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
già.... non penso si riferisse a me!

Grazie GFPina!
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°silvia°
Nuovo Arrivato


Prov.: Genova
Città: genova


100 Messaggi

Inserito il - 23 ottobre 2006 : 21:08:13  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di °silvia° Invia a °silvia° un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ah.. domandina(idiota) i pesi molecolari nella figura del gel sono espressi in Da o KDa?
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 24 ottobre 2006 : 00:35:52  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
KDa!
e per la precisione (non per fare pubblicità) sono le bande di uno standard Bio-Rad. Avevo trovato l'immagine qualche tempo fa in internet!
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°silvia°
Nuovo Arrivato


Prov.: Genova
Città: genova


100 Messaggi

Inserito il - 24 ottobre 2006 : 11:17:07  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di °silvia° Invia a °silvia° un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie!






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