Ciao! Mi permetto di risponderti perchè in questo periodo sto studiando il clonaggio per la messa a punto di una proteina di fusione e ho fatto qualche trasfezione. Quindi, dal quel che mi risulta, nella trasfezione (quando dobbiamo favorire l'ingresso del costrutto genico all'interno delle cellule eucariotiche per favorire l'espressione del gene di interesse), il DNA cioè il prodotto della ligation tra il vettore e l'inserto vale a dire questa nuova molecola di DNA ricombinante è supercoiled, in quanto l'inserto è ormai inserito all'interno del vettore grazie alla digestione con gli stessi enzimi di restrizione ( + defosforilazione per il vettore) e poi ligazione per rispristinare il legame fosfodiestereo tra le sticky ends.