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 amplificare in quantitativa relativa trascritti uguali
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Tommasina
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Inserito il - 06 marzo 2012 : 21:16:47  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Tommasina Invia a Tommasina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti! Ho un problemino riguardante l'amplificazione di cDNA. Ho due trascritti quasi identici di mRNA, dove la differenza è costituita dal fatto che il trascritto A è una variante di splicing, piu lunga del trascritto B. Il trascritto B è piu corto, ma non riesco a disegnare primers per distinguere fra loro perche il B, nella sua intera lunghezza, è completamente identico ad A (inizia semplicemente dopo) Per capire:

5'------------------------------------3' A
5'----------------3' B

Il mio obiettivo è quello trovare un modo per valutare in pcr semiquantitativa le differenze tra le varianti di splicing in cellule trattate con X.
Suggerimenti per la pcr o altre tecniche?

Tommasina
Nuovo Arrivato



29 Messaggi

Inserito il - 06 marzo 2012 : 21:22:31  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Tommasina Invia a Tommasina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
nel disegnino che ho messo la linea B ha slittato verso il 5'! il 5' del B inizia a circa metà del A...cioè sono omologhi a partire dalla metà 3' di A
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