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laura85
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106 Messaggi
Inserito il - 20 gennaio 2007 : 18:25:15  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di laura85 Invia a laura85 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao ragazzi!!
sto studiando la real time pcr ma sono usciti dei nomi che proprio non capisco e non so cosa sono...vi chiedo quindi un aiuto!!!
sybr green
sybr gold
yo yo
e yo pro...sono ds dna-biding agent giusto? che si intercalano nel dna ed emettono fluorescenza per visualizzare il prodotto di amplificato che sto ottenendo giusto??
ma sono in pratica sonde??
MOlecular Beacons e Scorpions sono dei tipi di sonde fluorescenti..sapreste dirmi come funzionano???
grazie

chick80
Moderatore

DNA

Cittā: Edinburgh


11491 Messaggi
Inserito il - 20 gennaio 2007 : 21:31:28  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sybr green, sybr gold e yo-pro sono intercalanti del DNA, tipo l'etidio bromuro. Non sono sonde nel senso che non hanno specificitā per una certa sequenza, ma per tutto il DNA ds.
Non conosco yo yo ma penso sia tipo lo yo pro.

I molecular beacon sono sonde fatte in modo da ottenere una struttura ad hairpin. Con la struttura ad hairpin non fluorescono perchč il fluoroforo č vicino ad un quencher.
Quando si legano al DNA durante l'amplificazione invece, l'hairpin si apre e il quencher si allontana dal fluoroforo.
Vedi http://www.molecular-beacons.org/Introduction.html

Gli scorpions sono molto simili, ma contengono uno dei primers.
vedi http://www.gene-quantification.de/chemistry.html#scorpions
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laura85
Nuovo Arrivato




106 Messaggi
Inserito il - 21 gennaio 2007 : 19:10:46  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di laura85 Invia a laura85 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie mille!!
corro subito a vedere i link
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laura85
Nuovo Arrivato




106 Messaggi
Inserito il - 21 gennaio 2007 : 19:41:32  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di laura85 Invia a laura85 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
posso dire che sei un grande?? e tutti quelli che qua rispondono sono dei grandi..il forum č bellissimo e utilissimo
GRAZIE perchč lo avete creato e continuate a lavorarci sopra
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