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Discussione |
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riotx
Nuovo Arrivato
Prov.: Avellino
20 Messaggi |
 Inserito il - 18 febbraio 2007 : 12:19:42
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Salve,
volevo sapere qual è il motivo che sta alla base della scelta tra lisi o lisogenia nel fago lampda...nel senso quali sono i fattori che determinano che si va in un senso o nell'altro...
Ringrazio anticipatamente
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"Le vibrazioni delle molecole" |
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aitan3
Nuovo Arrivato
Prov.: Napoli
71 Messaggi |
Inserito il - 19 febbraio 2007 : 14:13:02
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provo a risponderti:
quando il fago lambda infetta una cellula batterica effettua inizialmente il ciclo lisogenico integrando il proprio genoma nel genoma della cellula ospite. IN CONDIZIONI DI STRESS (elevata temperatura, elevata concentrazione di sale ecc.) effettua il ciclo litico cioè replica il proprio genoma,vengono sintetizzate le proteine della testa e della coda del virus, si formano nuove particelle virali e il batterio viene lisato con conseguente formazione delle cosidette placche fagiche. |
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riotx
Nuovo Arrivato
Prov.: Avellino
20 Messaggi |
Inserito il - 24 febbraio 2007 : 11:55:11
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| scusa se risp adesso cmq ti ringrazio...senti ma sai anche o qualcuno lo sa come funziona la storia dei geni precoci intermedi e tardivi? tnks |
"Le vibrazioni delle molecole" |
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ales
Utente Junior
Prov.: Palermo
Città: Palermo
455 Messaggi |
Inserito il - 17 maggio 2007 : 23:36:35
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| scusami ma in condizioni di stress non viene attivato il ciclo lisogenico? |
Ales |
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ales
Utente Junior
Prov.: Palermo
Città: Palermo
455 Messaggi |
Inserito il - 17 maggio 2007 : 23:41:04
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la scelta tra ciclo litico e lisogenico dipende dalle condizioni anbientali del batterio. quando il batterio è in un buona salute verrà attivato il ciclo litico se è in uno stato di carenza nutrizionale il ciclo lisogenico! |
Ales |
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Iside
Utente Attivo
Città: Napoli
1375 Messaggi |
Inserito il - 18 maggio 2007 : 13:02:15
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Citazione:
Messaggio inserito da riotx
scusa se risp adesso cmq ti ringrazio...senti ma sai anche o qualcuno lo sa come funziona la storia dei geni precoci intermedi e tardivi? tnks
ma ti riferisci al genoma di un virus in generale?
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...we're just two lost souls swimming in a fishbawl...year after year...
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Iside
Utente Attivo
Città: Napoli
1375 Messaggi |
Inserito il - 18 maggio 2007 : 13:05:13
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Citazione:
Messaggio inserito da ales
scusami ma in condizioni di stress non viene attivato il ciclo lisogenico?
 ...infatti!!!mi sa che aitan3 ha confuso le due cose, comunque è vero, in condizioni di stress (soprattutto di tipo ambientale), il batterio se ne sta buono buono nella cellula, entrando in ciclo lisogenico fino al ritorno delle condizioni favorevoli per potersi replicare: ciclo litico |
...we're just two lost souls swimming in a fishbawl...year after year...
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Gst
Utente Junior
Prov.: Roma
Città: Ariccia
143 Messaggi |
Inserito il - 19 maggio 2007 : 16:43:43
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Esatto Iside!....
D'altronde ha una sua logica: se in caso di carenza di nutrienti se il fago attivasse il ciclo litico, si replicherebbe ma i virioni non avrebbero altri batteri da infettare..., perchè in condizioni di stress la popolaz batterica è limitata e un'infezione seguita da ciclo litico potrebbe esaurirla addirittura, o cmq ridurla drasticamente.
Mentre se si attendono le condizioni favorevoli, la popolaz batterica è maggiore e qndi i batteri che sn lisati sn solo parte della popolaz, e qlli precedentemente nn infettati lo saranno dai nuovi virioni prodotti!
La "strategia" dovrebbe essere qsta....ovvio che il fago nn ne è consapevole
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Ascoltami con gli occhi... |
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aitan3
Nuovo Arrivato
Prov.: Napoli
71 Messaggi |
Inserito il - 19 maggio 2007 : 20:36:38
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scusate se risp solo adesso ma avete esattamente ragione;
è stato un mio errore di scrittura.
mi scuso ancora con Riotx.
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Danteye
Nuovo Arrivato
1 Messaggi |
Inserito il - 03 giugno 2007 : 10:34:34
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allora, a livello molecolare l' instaurarsi del ciclo litico o lisogenico è un discorso semplice ma difficile a spiegarsi.
A livello del genoma la zona più importante nel determinare la scelta tra via litica o via lisogenica è la zona composta dai geni cro, c1, c2, e dai promotori pr, pl, Prm, Pre.
Questi geni sono disposti in questo modo:
-----Pl------c1-------Prm------Pr--------cro---------c2-----Pre
---------------------Or3----Or2----Or1--------------------
sotto ho messo la disposizione degli operatori.
Pl e Pr sono dei promotori forti che non hanno bisogno di un attivatore per essere legati dalla dna polimerasi. C1 codifica per il repressore di lamda, una proteina con 2 domini uniti da una regione flessibile. Il repressore lambda si lega come dimero a Or1 e grazie al fatto che sul dominio C-terminale è presente un sito per la tetramerizzazione questo fa si che 4 repressori lambda si possano legare sia a Or1 sia a Or2. La spiegazione di questo comportamento è dovuta al fatto che il repressore si lega con un efficacia 10 volte superiore a Or1 piuttosto che ad Or2. Tramite la tetramerizzazione quindi si abbassa notevolmente di proteina richiesta per legare i due siti operatori. Or3 non viene legato.
Cro invece codifica per il repressore di Or3.
Quando la cellula viene infettata dal fago quindi la prima cosa che accade è il legame di Pol 3 a Pr e Pl e la sintesi di tutto ciò che è a valle dei due promotori. Pr codifica sia per cro che per C2. C2 codifica er un attivatore di pre e fa si che venga sintetizzato c1 a partire dal promotore pre. Quindi una volta infettata parte la sintesi da pr, vengono prodotti sia C2 che Cro che si legheranno a 0r3 e a pre. Se la quantità di repressore di C1 prodotto è in grado di legarsi a Or1 e Or2 prima che Cro riesca a legarsi a Or3 si avrà crescita lisogenica. la velocità di sintesi del repressore è quindi il "momento critico" tra la via litica e lisogenica...Da cosa è determinata quindi questa è velocità?
C2 è una proteina molto instabile e viene degradata da una proteina presente nel batteria denominata FtsH. Quando la cellula si trova quindi in condizioni di buona crescita l' attività di FtsH è alta, viene degradato molto c2 e si ha quindi crescita litica. Al contrario quando la cellula in condizioni di scarsa crescita ftsH ha un' attività molto debole e vi è quindi un accumulo di repressore che porterà ad una crescita lisogenica.
Dopo di che la sintesi di c1 verrà spostata da pre a Prm per il mantenimento del ciclo litico. C2 attiva anche il promotore PI per la sintesi delle integrasi indispensabili ai fini della lisogenia... |
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Dionysos
Moderatore
Città: Heidelberg
1913 Messaggi |
Inserito il - 17 giugno 2007 : 22:08:48
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Citazione:
la scelta tra ciclo litico e lisogenico dipende dalle condizioni anbientali del batterio. quando il batterio è in un buona salute verrà attivato il ciclo litico se è in uno stato di carenza nutrizionale il ciclo lisogenico!
Ma siete sicuri?
A me risulta che l'esplosione LITICA si abbia in condizioni di stress
e che l'integrazione profagica LISOGENICA si abbia finchè la cellule si moltiplica. |
Volere libera : questa é la vera dottrina della volontà e della libertà
(F.W. Nietzsche)
Less Jim Morrison, more Sean Morrison!
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cateee
Nuovo Arrivato
38 Messaggi |
Inserito il - 17 agosto 2008 : 12:50:05
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][navy][/navy
Dyonisos ha ragione...perchè stavo studiando questo proprio ora e mi risulta che in condizioni di stress si innesca il ciclo LITICO non Lisogeno, perchè in pratica il virus deve escindere dalla cellula batterica e lo fa in condizioni di stress per proteggersi... |
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cateee
Nuovo Arrivato
38 Messaggi |
 Inserito il - 17 agosto 2008 : 12:52:24
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scusa ti ho sbagliato il nome.. perdonami |
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fakestudent86
Nuovo Arrivato
Prov.: Vr
Città: Verona
68 Messaggi |
Inserito il - 17 agosto 2008 : 14:45:09
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....il fago lambda sceglie più probabilmente la via LITICA in cellule sane e in attiva divisione, perchè se la cellula cresce velocemente è plausibile che nei dintorni ci siano altre cellule da infettare. Viceversa se la cellula è quiescente o in difficoltà, il fago sceglie più probabilmente la via LISOGENICA...
Di questo sono assolutamente sicuro....!! |
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fakestudent86
Nuovo Arrivato
Prov.: Vr
Città: Verona
68 Messaggi |
Inserito il - 17 agosto 2008 : 14:47:18
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| Se non sei sicuro guarda nel libro "Biologia Molecolare del gene" del signor Watson(premio nobel insieme a Crik per la scoperta della struttura del DNA)...è da lì che ho studiato il fago lambda...! |
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Anyra
Utente Junior
Prov.: Pesaro-Urbino
Città: Saltara
212 Messaggi |
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Anyra
Utente Junior
Prov.: Pesaro-Urbino
Città: Saltara
212 Messaggi |
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fakestudent86
Nuovo Arrivato
Prov.: Vr
Città: Verona
68 Messaggi |
 Inserito il - 17 agosto 2008 : 19:29:02
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...mah....per scrupolo sono andato in giro per internet, e su una tesi di dottorato c'era proprio scritto quello che dico io...
non vedo il senso naturale di intraprendere un ciclo litico quando le condizioni non sussistono...
comunque bisogna dire anche che, anche se si creano le condizioni ideali per l'una o l'altra via, non è detto che TUTTI i fagi prendano la stessa strada...aumenti semplicemente la probabilità che il fago intraprenda quella strada...
Comunque prova a informarti su qualche testo oppure mi dici qualche altro sito, mi farebbe piacere risolvere questa questione perchè se no rimane il dubbio e continuo a pensarci ..E poi se salta fuori che hai ragione tu, una bella letterina al signor Watson non gliela leva nessuno...(visto che il libro costa anche un pochino) |
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cateee
Nuovo Arrivato
38 Messaggi |
Inserito il - 17 agosto 2008 : 21:44:52
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Citazione:
Messaggio inserito da fakestudent86
...mah....per scrupolo sono andato in giro per internet, e su una tesi di dottorato c'era proprio scritto quello che dico io...
non vedo il senso naturale di intraprendere un ciclo litico quando le condizioni non sussistono...
comunque bisogna dire anche che, anche se si creano le condizioni ideali per l'una o l'altra via, non è detto che TUTTI i fagi prendano la stessa strada...aumenti semplicemente la probabilità che il fago intraprenda quella strada...
Comunque prova a informarti su qualche testo oppure mi dici qualche altro sito, mi farebbe piacere risolvere questa questione perchè se no rimane il dubbio e continuo a pensarci..E poi se salta fuori che hai ragione tu, una bella letterina al signor Watson non gliela leva nessuno...(visto che il libro costa anche un pochino)
Guarda io lo so dalle dispense del mio prof e nonpenso che abbia detto una cosa per un'altra...anche perchè non ha molto senso che in condizioni di stress si rifugi nel batterio...se tu fossi su ua barca che affondache fai: ci stai dentro o cerchi di andartene??? magari hai capito male quello che ha scritto il signor Watson o semplicemente ci sono diverse teorie su questo, come accade molto spesso.... |
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cateee
Nuovo Arrivato
38 Messaggi |
Inserito il - 17 agosto 2008 : 21:50:05
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| inoltre, come ho letto nel libro "Brock Biologia dei microrganismi" un virus che è in stato di latenza in un batterio in seguito a induzione da parte di varie fenomeni (UV ecc...) entra nel ciclo litico...da questo potrai capire che è più probabile che il ciclo litico venga indotto anche in segito a condizioni di stress... |
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fakestudent86
Nuovo Arrivato
Prov.: Vr
Città: Verona
68 Messaggi |
Inserito il - 17 agosto 2008 : 22:24:53
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| .....boh allora sarà sbagliato il watson... |
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cateee
Nuovo Arrivato
38 Messaggi |
Inserito il - 18 agosto 2008 : 10:07:51
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Citazione:
Messaggio inserito da fakestudent86
.....boh allora sarà sbagliato il watson...
Io quel libro l'ho usato per l'esame di biologia molecolare e alle volte diceva cose che erano tutto il contrario di quello che c'era scritto in altri libri...ma chissà...
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cateee
Nuovo Arrivato
38 Messaggi |
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fakestudent86
Nuovo Arrivato
Prov.: Vr
Città: Verona
68 Messaggi |
Inserito il - 18 agosto 2008 : 13:18:05
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ok...grazie...ma allora perchè in ingegneria genetica, quando si usa lambda come vettore, per ottenerne un titolo alto, si infettano piastre ad esempio di E. coli in fase esponenziale(cioè in crescita e piena salute)?
stando a quanto detto il virus si dovrebbe integrare e non intraprendere un ciclo litico, e noi non otterremo nessun titolo di lambda....
Inoltre su usa un inoculo di E.coli non troppo concentrato perchè se no sperimentalmente non si ottiene un titolo abbastanza alto (quindi lo stress non può essere quello indotto dalla competitività)... |
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cateee
Nuovo Arrivato
38 Messaggi |
Inserito il - 18 agosto 2008 : 17:53:30
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| Ma io non penso che Lambda intraprenda sempre un ciclo lisogeno e intraprenda quello litico solo in caso di stress...magari ci sono delle situazioni in cui intraprende da subito(appena inocula il suo genoma nella cellula batterica) il ciclo litico e non entra in quello lisogeno...forse questa scelta dipende dagli enzimi che regolano il ciclo lisogeno, cioè da quelli che permettono al genoma virale di inserirsi nel cromosoma batterico (integrasi) e da quelli che gli permettono di rimanerci nel cromosoma... |
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fakestudent86
Nuovo Arrivato
Prov.: Vr
Città: Verona
68 Messaggi |
Inserito il - 18 agosto 2008 : 18:21:14
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capito...beh comunque grazie! Mi fa bene entrare in questo sito...
Perdonate la mia testardaggine, ma quando una cosa non mi convince rompo le scatole a tutti finchè non ci arrivo anch'io.... |
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Lisi o lisogenia
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