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stemcells09
Nuovo Arrivato

2 Messaggi

Inserito il - 03 dicembre 2015 : 16:24:34

Ciao a tutti,
pero di non essere off topic...mi sto approcciando per la prima volta al mondo della PCR e ho trovato diversi tools per disegnare primers. Ottenuti i primers li ho analizzati con MFEprimer2.0 e ho ottenuto questi risultati per hairpins and dimer

Tm 39.05 DeltaG(Kcal/mol) -0.16 Hairpins

Tm 17.89 DeltaG(Kcal/mol) -5.40 Dimer
Tm 12.92 DeltaG(Kcal/mol) -2.77 Dimer

Cosa indica il valore di deltaG? E le temperature di melting perch� sono cos� differenti?
Grazie a chiunque abbia il tempo e la pazienza di aiutarmi...

l�
Utente Junior

565 Messaggi

Inserito il - 11 dicembre 2015 : 12:05:57

Ciao!
Il programma elabora tutti gli hairpin e i dimeri che si possono verificare, motivo per cui hai Tm diverse.
Il deltaG indica la variazione dell'energia libera del sistema in seguito ad una reazione: � indice della spontaneit� di una reazione, perch� l'energia libera decresce per processi spontanei. Quindi pi� � basso il deltaG pi� sar� spontanea la reazione. Tuttavia, immagno che le Tm di 17.89 e 12.92 siano decisamente lontane dalla Tm dei tuoi primer.