L'EMSA (o Eloctrophoresis Mobility Shift Assay) o gel shift serve a vedere se una sequenza di DNA si lega a proteine. Dopo aver ottenuto il DNA in questione si prepara il gel: in un pozzetto (1) si carica il DNA ed in un altro (2) si carica un eccesso di DNA dopo incubazione con un estratto proteico. Nella corsia (1) il DNA migrerā in base alla sua grandezza, come sempre.. Nella corsia (2) se il Dna lega una proteina presente nell'estratto noterai 2 bande: una pesante ed una veloce. Quella pesante č data dal DNA che ha legato la proteina e sarā pertanto rallentata, quella veloce č invece dovuta all'eccesso di DNA che non ha legato la proteina.