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Tag   sequenziamento    fagi    termini  Aggiungi Tag

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Moxy
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1 Messaggi

Inserito il - 28 marzo 2024 : 15:44:48  Mostra Profilo Invia a Moxy un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Buonasera a tutti,
avevo un dubbio riguardante l'utilizzo dei kit Illumina Dna Prep (in generale quelli basati su trasposoni/tagmentation) per sequenziare i genomi fagici in cui ci sono a volte sequenze specifiche alle estremità del genoma lineare. Alcune guide sconsigliano l'utilizzo di questi kit (Nextera) perché non potendo inserirsi a monte di queste sequenze terminali non le si ritroveranno nelle reads e quindi nell'assemblaggio; altri articoli in cui vengono isolati nuovi fagi però usano comunque questi kit e indicano i genomi come completi... è possibile? In generale questi kit come fanno a garantire la presenza delle sequenze terminali anche ad esempio dei cromosomi umani?

Grazie
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