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scorza
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Prov.: Palermo
Città: palermo


30 Messaggi

Inserito il - 13 novembre 2007 : 10:09:58  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di scorza Invia a scorza un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
salve,spero che possiate aiutormi;
tra qualche giorno ho un esame di genetica molecolare e ho dei dubbi sulla tecnica aso dotblot.
potreste aiutarmi??come funziona??
ciao

Iside
Utente Attivo

Iside_paradise

Città: Napoli


1375 Messaggi

Inserito il - 13 novembre 2007 : 10:35:51  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Iside  Invia a Iside un messaggio Yahoo! Invia a Iside un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
se ne era parlato anche quì:
http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=1375&SearchTerms=dot,blot


...we're just two lost souls swimming in a fishbawl...year after year...
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scorza
Nuovo Arrivato


Prov.: Palermo
Città: palermo


30 Messaggi

Inserito il - 13 novembre 2007 : 10:46:05  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di scorza Invia a scorza un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
quindi non si fa la pcr?
io credo di aver letto che prima si faceva la pcr e poi l'ibridazione su membrana con sonde....è possibile???
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Iside
Utente Attivo

Iside_paradise

Città: Napoli


1375 Messaggi

Inserito il - 13 novembre 2007 : 11:34:19  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Iside  Invia a Iside un messaggio Yahoo! Invia a Iside un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
credo che si faccia su DNA cromosomico.

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scorza
Nuovo Arrivato


Prov.: Palermo
Città: palermo


30 Messaggi

Inserito il - 13 novembre 2007 : 11:49:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di scorza Invia a scorza un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
a me interessava saperlo per la diagnosi della fibrosi cistica
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 13 novembre 2007 : 14:08:26  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
No si fa su amplificato!
Si amplifica mediante PCR uno o più frammenti del gene che si vuole studiare.
Si legano i prodotti di PCR ad un filtro di nitrocellulosa e si fanno ibridare con sonde ASO (Allele Specific Oligonucleotide), in genere una coppia per ogni mutazione che si vuole analizzare, una che si lega al wt e una al mutato!
Le sonde sono marcate radioattivamente oppure biotinilate, dopo l'ibridazione e gli oppurtuni lavaggi solo le sonde complementari rimangono attaccate al filtro e dopo rivelazione è possibile visualizzare sulla membrana degli "spot" dove DNA e sonda si sono legati e quindi identificare le mutazioni.

Questo è il dot-blot, esiste anche il reverse dot-blot in cui fai il contrario, leghi alla membrana le sonde! In questo caso è il prodotto di PCR però ad essere marcato!
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Iside
Utente Attivo

Iside_paradise

Città: Napoli


1375 Messaggi

Inserito il - 13 novembre 2007 : 14:17:48  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Iside  Invia a Iside un messaggio Yahoo! Invia a Iside un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
hai ragione GFPina! si fa su amplificato!
comunque, scorza, quì c'è un bell'articolo sull'uso delle tecniche nella diagnosi molecolare di FC tra cui l'ASO dot-blot


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scorza
Nuovo Arrivato


Prov.: Palermo
Città: palermo


30 Messaggi

Inserito il - 13 novembre 2007 : 14:20:19  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di scorza Invia a scorza un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie tante!!!
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scorza
Nuovo Arrivato


Prov.: Palermo
Città: palermo


30 Messaggi

Inserito il - 14 novembre 2007 : 11:20:31  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di scorza Invia a scorza un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
scusate....ma c'è differenza con la tecnica ARMS?
sembrano molto simili...
ciao
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Talia
Nuovo Arrivato

talia

Prov.: Napoli
Città: Napoli


35 Messaggi

Inserito il - 30 giugno 2008 : 23:07:38  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Talia  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Talia Invia a Talia un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ma quindi sia nell'ASO che nel REVERSE DOT BLOT utilizzo 2 tipi di sonda durante l'esperimento?Sia quella per l'allele mutato che quella per l'allele wild type?
Se è così...come faccio,nel momento in cui c'è ibridazione a capire se ha ibridato la sonda per l'allele mutato o quella per l'allele wild type?

Talietta
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 01 luglio 2008 : 18:57:52  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da Talia

Se è così...come faccio,nel momento in cui c'è ibridazione a capire se ha ibridato la sonda per l'allele mutato o quella per l'allele wild type?

Beh ovviamente devi utilizzare due membrane!
Una la fai ibridare con la sonda wt e una con la sonda mut.
Se hai un reverse dot blot sai dove sono legate le sonde e quindi puoi analizzare più sonde contemporaneamente, ma ovviamente un singolo campione alla volta.

Comunque adesso ormai si utilizzano i microarray, in questo caso le sonde (o i campioni) sono marcati con fluorofori differenti e puoi analizzarli sullo stesso supporto!
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Talia
Nuovo Arrivato

talia

Prov.: Napoli
Città: Napoli


35 Messaggi

Inserito il - 01 luglio 2008 : 19:05:02  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Talia  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Talia Invia a Talia un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ok,ti ringrazio...
Credevo che nell'ASO si potessero discriminare le due diverse sonde sulla stessa membrana magari perchè erano marcate con radioisotopi diversi!:)

Talietta
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