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turok
Nuovo Arrivato
Prov.: Siracusa
Città: Siracusa
47 Messaggi |
 Inserito il - 24 novembre 2007 : 16:54:04
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Ciao ragazzi, avrei bisogno di alcune informazioni circa gli argomenti che vi presento.
Passatemi tutto ciò che sapete riguardo a queste cose, poi sarò io a selezionare le cose che mi interessano di più.
Grazie anticipatamente a tutti.
Ecco gli argomenti:
1. Quante ORF sono presenti su di un filamento di DNA? e perchè?
2. Come si forma i8l gel di poliacrilamide (il processo chimico-fisico che porta alla formazione del gel)?
3. Cosa è la Nested PCR?
4. Sapete i cluster detction (CD) dei vari tipi di linfociti (T, B, NK, Th ecc.)?
5. Cosa è la PFU turb TAQ start?
6. Cosa si intende per multiplex?
7. Come agisce la tecnica TaqMan?
grazie, grazie e ancora grazie a tutti.
Scusate la mia ignoranza e spero che le domande non siano troppe.
Complimenti per questo fantastico forum, siete grandissimi .
Ciao
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Non è perchè le cose sono difficili che non osiamo, ma è perchè non osiamo che le cose sono difficili.
Seneca.
è più facile spezzare un atomo che un pregiudizio.
Albert Einstein. |
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Eleo
Nuovo Arrivato
Prov.: Pavia
89 Messaggi |
Inserito il - 24 novembre 2007 : 17:30:54
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bioweb.uwlax.edu/GenWeb/Molecular/Seq_Anal/Translation/translation.html (ORF)
it.wikipedia.org/wiki/Gel_di_poliacrilammide (gel di poliacrilammide)
3. Nested PCR
Si tratta di realizzare due PCR successive utilizzando coppie di primers differenti, con la seconda che inquadra una sequenza inclusa in quella amplificata dalla prima coppia.
Se la prima amplificazione è artefattuale, nella seconda i primers non si appaieranno!
In questo modo aumento:
- Specificità
- Tasso di amplificazione (da molecularlab nella sezione tecniche (PCR))
www.bio.davidson.edu/courses/genomics/method/NestedPCR.html (nested PCR)
PFU è una polimerasi ad alta fedeltà
en.wikipedia.org/wiki/Pfu_DNA_polymerase (pfu)
en.wikipedia.org/wiki/TaqMan (TaqMan)
www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/genome/probe/doc/ProjTaqMan.shtml (TaqMan)
per il resto ti cercherò informazioni
ciao
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Neuroscience
Utente
659 Messaggi |
Inserito il - 25 novembre 2007 : 00:17:22
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Citazione:
Messaggio inserito da turok
1. Quante ORF sono presenti su di un filamento di DNA? e perchè?
Significa Open Reading Frame, ovvero una regione di cDNA che parte dall'ATG che codifica per l'aminoacido Metionina ed arriva ad un codone di stop...
per contare gli ORF si usano programmi dedicati che leggono le sequenze di DNA e valutano le distanze dall'ATG fino ad un codone di stop, nei tre frame di lettura
ATG CAT GAT GAT...
A TGC ATG ATG AT...
AT GCA TGA TGA T...
quanto più è lunga la distanza tra l'ATG ed il codone di stop, più probabilità ci sono che si tratta di una sequenza codificante, poche sono le probabilità che sia casuale una sequenza priva di codoni di stop.
2. Come si forma i8l gel di poliacrilamide (il processo chimico-fisico che porta alla formazione del gel)?
Trovi tutto su internet, processo banalissimo
3. Cosa è la Nested PCR?
Una PCR "nidificata" ovvero una PCR fatta su un DNA ottenuto già per PCR.
ovvero fai una PCR ed ottieni una banda.
Su questa banda purificata fai un'altra PCR con dei primers diversi da quelli che hai usato prima e che ti amplificherà una banda più piccola.
In genere serve per verificare che un prodotto di PCR sia specifico, altrimenti la seconda PCR non può uscire.
4. Sapete i cluster detction (CD) dei vari tipi di linfociti (T, B, NK, Th ecc.)?
sono degli epitopi, dei punti in cui si possono agganciare anticorpi o altro, ovvero delle proteine (o complessi di proteine) con funzioni diverse che servono (a noi) per identificare il tipo di popolazione cellulare ed il suo stato di attivazione/disattivazione etc.
5. Cosa è la PFU turb TAQ start?
Sono dei diversi tipi di DNA polimerasi con caratteristiche peculiari, la PFU ha un'alta fedeltà, la Taq Hot start funziona con bassa fedeltà e solo dopo che è stata esposta ad un'alta temperatura.
6. Cosa si intende per multiplex?
PCR fatte con diversi primers/sonde contemporaneamente nello stesso tubo
7. Come agisce la tecnica TaqMan?
Meglio che trovi spiegazioni su internet, cerca "Real-Time PCR" e "Taqman"
buona ricerca
P.S.: La prossima volta all'apertura di un thread, ti prego di inserire un titolo più specifico, così le persone possono capire se è di loro competenza quello che chiedi.
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