Vediamo se qualcuno mi può aiutare: il mio dubbio è sulla elettroforesi in campo pulsante. So la tecnica, ma non so lo scoppo di questa. Qualcuno mi sa dire per a che si utilizza?
Gracie!
Se comprendere è impossibile, conoscere è necessario. (Primo Levi)
L'elettroforesi su gel di agarosio non è in grado di risolvere molecole molto grosse ( > 30 Kb) cioè un frammento di DNA di 30 Kb migrerà nella stessa posizione di uno di 60 Kb. Entrambi i frammenti sono in grado di entrare nei pori del gel ed attraversali guidati dalla corrente elettrica, ma non si ottiene la loro separazione (nemmeno utilizzando gel più lunghi o abbassando la concentrazione dell'agarosio nel gel). PFGE modificando la direzione della corrente elettrica per alterare il cammino delle molecole di DNA risolve poco più di 10.000 kb. Il DNA è forzato a cambiare direzione, dalla banda larga e diffusa iniziano a separarsi frammenti con differente dimensione. Probabilmente il cambiamento di direzione inibisce o riduce la formazione di grovigli. ad ogni orientamento del campo elettrico rispetto al gel, i frammenti di DNA più piccoli inizieranno a muoversi nella nuova direzione piuù velocemente di quelli più grossi.Quindi il DNA più grosso resta indietro , permettendo la sua separazione dai frammenti piccoli.