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phageman
Nuovo Arrivato
Prov.: Padova
2 Messaggi |
 Inserito il - 27 dicembre 2005 : 18:03:29
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io ho ristretto del dna fagico con enzimi di restrizione e dopo corsa elettroforetica su gel di agarosio 1% con un marker ad alto peso molecolare (Hind III), voglio calcolarmi il peso molecolare delle bande. ma come fare? qulacuno di voi sa come fare?
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 27 dicembre 2005 : 23:42:35
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Ma vuoi il peso molecolare o la lunghezza?
Cmq:
Ovviamente se non hai la sequenza delle basi ti dovrai accontentare di qualcosa tipo:
PM = [(Ax312.2) + (Gx328.2) + (Cx288.2) + (Tx303.2) - 61.0]
PM = 307.7 * numero di basi (307.7 e' la media dei pesi della formula sopra)
Se vuoi sapere il peso (prima di far correre il gel) fai una lettura a 260 e hai
1 OD260 = 33ug DNAss
1 OD260 = 50ug DNAds |
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phageman
Nuovo Arrivato
Prov.: Padova
2 Messaggi |
Inserito il - 28 dicembre 2005 : 09:54:03
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| il fatto è che nn si conosce la sequenza e quindi nn so la quantita di a g c t. io pensavo di calcolarmi la distanza delle bande del marker dal pozzetto e farmi un grafico e poi tramite una retta di regressione calcolarmi i pesi delle bande di restrizione calcolando la distanza dal pozzetto. |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 28 dicembre 2005 : 10:32:13
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No asp... cosi trovi la lunghezza non il peso molecolare!
E ricorda che devi fare un grafico semilogaritmico o non funziona! |
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selenaddict
Nuovo Arrivato
60 Messaggi |
Inserito il - 09 ottobre 2015 : 12:42:09
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| in questo momento mi sfugge ma potreste spiegarmi cos'è quel -61.0? , questa formula ovviamente è riferita a ssDNA ? |
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