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Messa a punto nuova tecnica di sequenziamento del DNA virale

Struttura virus HIV


La nuova tecnica si basa sul pirosequenziamento e sull'ausilio di nuove strumenti statistici e matematici

Presso l'ETH di Zurigo, grazie ad una collaborazione internazionale tra ricercatori svizzeri e americani, è stato sviluppato un nuovo processo per il sequenziamento del DNA virale. I ricercatori hanno basato il loro lavoro sul pirosequenziamento, una nuova tecnica di sequenziamento del DNA. Poiché con questa tecnica si riuscivano ad ottenere delle letture “brevi” e piene di errori, gli scienziati hanno sviluppato degli strumenti statistici e matematici per l'analisi dei dati, in grado di migliorarne i risultati.
Il nuovo metodo sviluppato ha dimostrato di poter diminuire il tasso di errore e di fornire informazioni più velocemente e in modo più efficiente. I ricercatori hanno applicato il metodo a quattro popolazioni del virus HIV-1 ottenute da pazienti resistenti alla terapia farmacologica e, in seguito, le hanno confrontate con 165 sequenze ottenute direttamente mediante sequenziamento, per esempio per clonazione dagli stessi campioni.
Niko Beerenwinkel, ricercatore dell'ETH, ha spiegato: “Queste nuove tecniche producono risultati molto simili alle tecniche convenzionali, ma con una risoluzione potenzialmente più alta e con un costo inferiore”. Per la ricerca biomedica, la conoscenza del DNA delle popolazioni virali è un passo decisivo per comprendere meglio la malattia, la sua progressione, per studiare la resistenza ai farmaci e per mettere a punto terapie e vaccini. La notizia è apparse sull'ultimo numero della rivista on line “PLoS Computational Biology”.

Redazione MolecularLab.it (12/05/2008)
Pubblicato in Biotecnologie
Tag: virus, genoma, DNA, pirosequenziamento, sequenziamento
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