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Gingy88
Nuovo Arrivato

Zenzy


56 Messaggi
Inserito il - 16 gennaio 2012 : 13:39:54  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Gingy88 Invia a Gingy88 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Buongiorno a tutti! Sono nuova di qui!
La mia domanda riguarda l'analisi delle comunità microbiche..non capisco perchè dopo PCR di rRNA 16S si debba eseguire il clonaggio e sequenziamento..io pensavo che i prodotti di PCR potessero essere direttamente sequenziati essendo già amplificati...forse c'entra in qualche modo il fatto che l'rRNA 16S ottenuto con la PCR è misto(cioè di più microrganismi)?

Grazie mille a tutti =)

Gingy88
Nuovo Arrivato

Zenzy



56 Messaggi
Inserito il - 18 gennaio 2012 : 20:40:08  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Gingy88 Invia a Gingy88 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ok, mi rispondo da sola perchè ho scoperto la risposta alla mia domanda, comunque la scrivo qui lo stesso se qualcuno un giorno ne avesse bisogno eheh

Il clonaggio dopo una pcr standard serve per separare l'rRNA 16S misto in modo da poter sequenziare separatamente i diversi tipi di rRNa :) Mentre se si utilizza una PCR del tipo DGGE le molecole di rRNa16S vengono direttamente separate e possono essere sequenziati senza clonaggio!
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