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CromX81
Nuovo Arrivato
3 Messaggi |
 Inserito il - 10 gennaio 2011 : 15:51:00
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Ciao a tutti!
Devo iniziare una linea di ricerca tutta sola e nn so davvero da dove partire per la pianificazione del lavoro.
Avete idea di come potrei studiare la funzione endocrina (nn ancora mai dimostrata da nessuno) di una proteina di cui ad oggi si conosce solo un ruolo autocrino? Cosa potrei fare su un modello in vitro?
Help me!
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 10 gennaio 2011 : 18:29:01
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Ciao CromX81!
Forse dovresti essere un pochino più preciso/a su quello che stai studiando... capisci che gli esperimenti da fare varieranno tantissimo a seconda del caso.
Sicuramente per guardare una funzione endocrina usare un modello in vitro potrebbe essere un pochino restrittivo. Tuttavia già potresti cominciare a vedere se la tua proteina ha un effetto (es. attivazione di qualche pathway intracellulare etc) su delle cellule di un tessuto in cui essa non è prodotta, ma che tu pensi sia uno dei suoi possibili target.
Un'altra cosa che potresti fare è vedere se esistono dei recettori per questa proteina in altri tessuti o comunque su cellule che non la producono.
Sicuramente ci sono moltissimi altri approcci, ma dipende davvero dal singolo caso è difficile dare una risposta generica. |
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CromX81
Nuovo Arrivato
3 Messaggi |
Inserito il - 10 gennaio 2011 : 19:38:19
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Grazie Chick80!
Scusami se sono stata un po' vaga, ma non mi sembrava il caso di scendere nel dettaglio.
Lo faccio ora :)
Si tratta di una proteina appartenente alla famiglia degli ormoni insulino-simili (tipi IGF1 e 2) di cui è stata accertata soltanto la funzione sulla maturazione delle gonadi ma, poiché i suoi livelli periferici nell'adulto sono molto elevati, abbiamo pensato che un motivo ci sara' e che questo motivo potesse essere una eventuale funzione endocrina. Tanto piu' che è stata accertata la presenza del suo recettore in altri tipi di tessuto che non la producono (tessuto muscolare, cervello, reni, tiroide, midollo osseo).
Navigo nel buio perché è la prima volta che mi trovo a gestire da sola una linea di ricerca... |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 10 gennaio 2011 : 20:02:58
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Innanzitutto comincia a scegliere un paio di tessuti a cui vuoi interessarti (e che esprimono il recettore).
Dopodichè metti bene in chiaro quali sono le domande a cui vuoi rispondere. Questo è il punto principale. Una volta che hai deciso a che domande vuoi rispondere puoi pensare a che esperimenti fare.
Gli esperimenti dipenderanno molto dall'expertise del tuo lab.
Ad es. puoi fare del WB o ICC/IHC per vedere l'attivazione di specifici pathway intracellulari.
Nel tessuto nervoso e muscolare puoi pensare a fare dell'elettrofisiologia.
Sicuramente dovrai trovare delle linee cellulari di questi tessuti o, se avete a disposizione degli animali, potrai direttamente prelevare il tessuto stesso (in quel caso puoi prelevare tutti i vari tessuti che hai nominato).
Poi guarda la letteratura a riguardo nelle gonadi. Che cosa si sa di questa proteina? Che funzioni svolge lì? Ci sono funzioni simili a cui puoi pensare negli altri tessuti? Ad es. se questa proteina promuovesse la replicazione cellulare potresti vedere se un trattamento con la stessa aumenta la crescita cellulare negli altri tessuti.
Il tutto ovviamente deve essere misurato alla quantità di tempo, persone e denaro disponibili per il progetto. |
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zerhos
Utente Junior
Prov.: Pisa
Città: Pisa
421 Messaggi |
Inserito il - 11 gennaio 2011 : 00:56:33
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Se lavori su colture, potresti anche fare (se ne fate) un RNAi o un morfolino sul recettore della tua proteina e vedere cosa succede.
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Salvador.Dalì
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