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mikkc
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Inserito il - 27 aprile 2020 : 21:09:02  Mostra Profilo Invia a mikkc un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti,
sto analizzando (tramite un elaborato in python) la interazione proteica, e dopo aver studiato/analizzato il network, vorrei studiare per ciascun enzima la cinetica entimatica tramite l'equazione di Michaelis-Menten ma ho dei dubbi.

Come ricavare Vmax e km? valori che passo alla funzione al momento del calcolo. Ho letto da qualche parte che i valori sono specifici per ciascun enzima ma come faccio se ho almeno 300 proteine se va bene?
Considerando che il file che carico è sempre diverso, come posso fare?

Ho preso V = Vm*x/(x+km) dove x è il substrato



mikkc
Nuovo Arrivato



4 Messaggi

Inserito il - 28 aprile 2020 : 01:05:03  Mostra Profilo Invia a mikkc un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Studiando un pò qua e la ho trovato questa informazione: km e Vmax si calcolano mediante il piano di Lineweaver e Burk, o doppi reciproci, (interpolazione dei dati a mezzo della regressione lineare).

Ora, quali dati devo considerare? Ho effettuato la sola analisi del network.
Qualcuno mi sa consigliare?

Forse a questo punto, si tratta più di Biotecnologie che di Biochimica?
Pardon, sto studiando ora questa parte ma non mi occupo di biologia e mi farebbe comodo una guida.
E' il primo elaborato di analisi network che creo. La interazione proteica mi interessa molto e mi piacerebbe approfondire ma avrei bisogno di qualche dritta su come utilizzare i dati a disposizione.

Grazie
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