Ciao a tutti ho un problema con gli housekeeping gene... Ho fatto una RT-PCR per una proteina legante il calcio caratterizzata da una struttura secondaria nota come EF-Hand. Per normalizzare il mio dato ho usato come housekeeping gene la tubulina (non ho provato GAPDH o altri), ma purtroppo l'andamento del normalizzatore è lo stesso del mio gene X. AUmentano e diminuiscono insieme nel trattamento, NON POSSO NORMALIZZARE?!:O PS. si escludono errori nei passaggi precedenti (estrazione rna, rt e via di seguito).
Scusate come al solito se non sono stata chiara ma spero in teoria di aver un pò reso l'idea Grazie
Si, infatti.. ti sei risposto da solo "non ho provato la GAPDH". Bene, provala! :D O c'è un motivo per cui DEVI usare la tubulina? Non penso, per la normalizzazione si può usare tutto ciò che sia housekeeping (e non modulato tra i tuoi 2 gruppi di campioni).