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silviolivio
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Prov.: napoli
Città: trecase


47 Messaggi

Inserito il - 25 gennaio 2007 : 16:23:29  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di silviolivio  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di silviolivio Invia a silviolivio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
studiando i metodi di riparazione del dna ho trovato incongruenze fra due testi il primo il russel di genetica ed il secondo il karp di biologia.

il problema è questo:

il russel dice in maniera specifica che il meccanismo di riparazione per escissione di nucleotidi è ritrovato solo in procariotoed eucarioti inferiori e gli enzimi convolti in tale meccanismo sono chiamati Uvr A-B-C-D. il fatto che si tratti di procarioti è sottolineato dal fatto anche che nello stess contesto si parli di DNA polimerasi I (specifica dei procarioti)

il KARP invece non specifica se il NER (nucleotide excission repair) sia valido per procarioti solo o anche eucarioti...bensì identifica due vie di attivazione di tale meccanismo 1)il segnale dell'errore è il blocco di una RNA pol durante la trascrizione (via accoppiata alla trascrizione).
il probela sorge quando nella stesso contesto il karp mi parla di polimerasi delta ed epsilon specifiche di eucarioti...

qualche delucudazione?
2)l'errore è ricoosciuto da una proteina XPC (via globale)

me
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15 Messaggi

Inserito il - 25 gennaio 2007 : 17:13:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di me Invia a me un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao!
Il meccanismo di riparazione per excisione della base danneggiata è presente sia negli eucarioti che nei procarioti.
Mi sembra di capire che il Russel ti stia parlando del meccanismo di azione e delle proteine del NER (Nucleotide Excision Repair) dei procarioti, mentre il Karp ti descrive i due due meccanismi di azione del NER degli eucarioti. In particolare, il primo che hai citato si chiama TCR-Transcription Coupled Repair, mentre il secondo è detto GGR- Global Genome Repair .
Il TCR si occupa della riparazione delle lesioni presenti sullo strand trascritto del DNA, mentre il GGR è deputato alla riparazione dei danni che colpiscono lo strand non trascritto e le regioni non codificanti del genoma.
Il NER è solo uno dei tre meccanismi di riparazione per excisione presenti negli eucarioti e nei procarioti. Gli altri due sono il BER (Base Excision Repair) e il MMR (MisMatch Repair).
Il NER si occupa di riparare i danni che insorgono in seguito all’esposizione a raggi UV (come i dimeri di timina), il BER rimuove le basi ossidate, alchilate o danneggiate da specie reattive all’ossigeno e ripara le lesioni causate da eventi di depurinazione dei nucleotidi e di deamminazione delle basi azotate, mentre il MMR corregge gli appaiamenti errati dovuti all’introduzione di una base non complementare a quella del filamento stampo, durante la replicazione.
In tutti e tre i sistemi di excision repair, il processo riparativo si realizza in quattro passaggi successivi: riconoscimento del danno, taglio e rimozione del frammento di ssDNA contente la lesione ed infine riempimento del gap generato attraverso a uno step di sintesi riparativa.
Spero di esserti stata utile!


http://users.rcn.com/jkimball.ma.ultranet/BiologyPages/D/DNArepair.html
http://en.wikipedia.org/wiki/Mismatch_repair
http://en.wikipedia.org/wiki/Nucleotide_excision_repair
http://en.wikipedia.org/wiki/Base_excision_repair
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.section.8425
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silviolivio
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Prov.: napoli
Città: trecase


47 Messaggi

Inserito il - 25 gennaio 2007 : 17:45:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di silviolivio  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di silviolivio Invia a silviolivio un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
molto molto utile. grazie mille
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