Carissimi..qualkuno utilizza la T4 DNA ligasi della Takara? In tal caso potreste darmi il protocollo relativo? Nello sheet del prodotto nn se ne fa menzione..tanto meno sul catalogo ke ho qui in laboratorio..fino ad ora ho lavorato con la T4 della fermentas ke agisce incubando 1h a 22°C e disattivando x 10 minuti a 65°C ma nn credo vada bene anke x l'enzima Takara.
Mah? Secondo me non ci dovrebbero essere differenze tra i protocolli di T4 DNA ligasi di diverse case. Sul protoccollo della mia T4 DNA ligasi c'e scritto di utilizzarla: 1 h a 23-26°C per Cohesive Ends 16-24 h a 14°C per Blunt Ends
Inoltre...è possibile ke abbia un problemino di diluizione..cioè il mio enzima è 350U/microlitro..x una ligasi di solito si usano da 1 a 5 U in una reazione..ciò vorrebbe dire diluire di un casino di volte la mia ligasi...ma se invece lavorassi senza la diluizione..oltre ke (ovviamente) sprecare + enzima..cosa potrebbe accadere alla reazione?
ti va in saturazione la reazione, ma sprechi solo l'enzima. Cmq il protocollo non dovrebbe variare da marca a marca. Prova solo a diluire, la concentrazione iniziale mi sembra eccessiva...