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mjdm
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12 Messaggi

Inserito il - 29 gennaio 2012 : 15:02:52  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di mjdm Invia a mjdm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao ragazzi.. Ho bisogno di un aiutino! Vi posto un esercizio completo di soluzione:

L’ordine e le relazioni di associazione di tre geni sul cromosoma 9 di granturco
sono rappresentate dalla mappa:
pg---- gl------- bk
64     69        79

Gli alleli recessivi determinano rispettivamente piante verde pallido (pg), foglie
lucide (gl) e foglie fragili (bk). Il coefficiente di coincidenza per questa regione è
0,6. Determinare i fenotipi ed i numeri attesi in una progenie di 2000 individui
dall’incrocio:
Pg gl Bk   x  pg gl bk
pg Gl bk      pg gl bk


RISPOSTA
Dalla figura si evince che la distanza pg-gl è 5cM e la distanza gl-bk è 10cM. I
numeri attesi in caso di cc = 1 saranno quindi:
Pg gl Bk (parentale) (0,95x0,90)/2 = 0,4275 x 2000 = 855
pg Gl bk (parentale) (0,95x0,90)/2 = 0,4275 x 2000 = 855
Pg Gl bk (ricombinante in zona I) (0,05x0,90)/2 = 0,0225 x 2000 = 45
pg gl Bk (ricombinante in zona I) (0,05x0,90)/2 = 0,0225 x 2000 = 45
Pg gl bk (ricombinante in zona II) (0,95x0,10)/2 = 0,0475 x 2000 = 95
pg Gl Bk (ricombinante in zona II) (0,95x0,10)/2 = 0,0475 x 2000 = 95
Pg Gl Bk (doppio ricombinante) (0,05x0,10)/2 = 0,0025 x 2000 = 5
pg gl bk (doppio ricombinante) (0,05x0,10)/2 = 0,0025 x 2000 = 5
Poiché tuttavia cc = 0,6 allora i doppi ricombinanti osservati dovranno essere il
60% dell’atteso (con cc = 1), quindi numericamente dovranno essere 3 + 3 anziché
5 + 5. Di conseguenza i ricombinanti singoli dovranno essere 47 + 47 in zona I e
97 + 97 in zona II, e i parentali dovranno essere 853 + 853. Questo perché i doppi
ricombinanti perduti vanno aggiunti ai ricombinanti singoli per mantenere
inalterata la distanza di mappa (cioè sono aggiunti due volte) e poi l’eccesso di
prole va sottratto dai parentali.

Allora calcolarmi la frequenza di ogni singola classe DS non è in problema..ma non riesco a capire come si calcola la frequenza delle classi con ricombinazioni in una singola regione!!!

JGuardaGliUfo
Utente

Mafalda

Città: Roma


641 Messaggi

Inserito il - 29 gennaio 2012 : 15:21:15  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di JGuardaGliUfo Invia a JGuardaGliUfo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
La soluzione che hai postato è la tua?

Citazione:
Allora calcolarmi la frequenza di ogni singola classe DS non è in problema


DS sta per DR? Doppi Ricombinanti?

I could not love except where Death
Was mingling his with Beauty’s breath —
Or Hymen, Time, and Destiny
Were stalking between her and me.

E. A. Poe
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mjdm
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12 Messaggi

Inserito il - 30 gennaio 2012 : 12:29:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di mjdm Invia a mjdm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
No,no..la soluzione era insieme all'esercizio..cmq si,per DS intendo doppi scambi ovvero doppi ricombinanti!

Non riesco a capire perchè calcola i ricombinanti in prima regione per esempio in questo modo:
(0,05x0,90)/2 = 0,0225 x 2000 = 45
cioè, (0,90) sarebbe la percentuale dei casi in cui,mentre avviene lo scambio in prima regione,nella seconda no..giusto?
Ma a quel punto questi valori della ricombinazione in seconda regione non mi tornano...
(0,95x0,10)/2 = 0,0475 x 2000 = 95
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JGuardaGliUfo
Utente

Mafalda

Città: Roma


641 Messaggi

Inserito il - 30 gennaio 2012 : 12:50:53  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di JGuardaGliUfo Invia a JGuardaGliUfo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Innanzitutto,guarda questi post:

- http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=24589&SearchTerms=coefficiente,di,coincidenza

- http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=4600&SearchTerms=spock


Citazione:
Non riesco a capire perchè calcola i ricombinanti in prima regione per esempio in questo modo:
(0,05x0,90)/2 = 0,0225 x 2000 = 45
cioè, (0,90) sarebbe la percentuale dei casi in cui,mentre avviene lo scambio in prima regione,nella seconda no..giusto?



0,90 è la probabilità che un crossing over non si verifichi in regione II. 0,90 si calcola come 1-0,10; dove 0,10 è la probabilità che un crossing over si verifichi in regione II. Quindi, la probabilità combinata che un crossing over non si verifichi nella regione II ma nella I è: 0,05 x 0,90. Il risultato lo dividi per le due classi.

Citazione:
Ma a quel punto questi valori della ricombinazione in seconda regione non mi tornano...
(0,95x0,10)/2 = 0,0475 x 2000 = 95


E' lo stesso anche in questo caso. 0,95 è calcolato come 1-0,05: la probabilità che un crossing over non si verifichi in regione I.

I could not love except where Death
Was mingling his with Beauty’s breath —
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E. A. Poe
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