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conny
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3 Messaggi

Inserito il - 31 maggio 2007 : 18:58:41  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di conny Invia a conny un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao ragazzi...qualcuno mi spiega cos'è un STS e come si usa...in modo particolare lo sto studiando abbianato alla pcr in determinazione di mappe genetiche....HELP ME!!!!.....Grazie

norty89
Nuovo Arrivato

TAQ

Prov.: Reggio Calabria
Città: Reggio Calabria


25 Messaggi

Inserito il - 13 giugno 2007 : 15:43:48  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di norty89  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di norty89 Invia a norty89 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Qualcosa ho trovato

Sequence tagged site ( o STS ) è una sequenza corta di DNA ( da 200 a 500 coppie di basi )che si trova solo una volta in un genoma ed è localizzata in una sequenza di basi conosciuta.

Le STS possono trovate con una PCR ( polymerase chain reaction ), e sono utili per localizzare e orientare il mapping e i dati di sequenza riportati da molti laboratori. Servono anche come pietre miliari nello sviluppo fisico della mappa di un genoma.

La mappa con gli STS puo' essere rappresentata elettronicamente e conservata in una banca dati facilmente accessibile. Un STS identifica in maniera univoca un qualsiasi tratto di DNA e pertanto un laboratorio che voglia clonare uno specifico frammento genomico, dovra' semplicemente consultare un computer per conoscere le due sequenze STS che delimitano questo frammento. Usando due primers corrispondenti alle due sequenze STS, si potra' amplificare mediante PCR il frammento e successivamente clonarlo. Poiche' nella reazione di amplificazione l'enzima usato non riesce ad amplificare frammenti superiori a 1000 pb, i primers scelti, corrispondenti alle due sequenze STS che delimitano il frammento da clonare, non devono distare piu' di 1000 pb.
Poiche' ogni elemento mappato (cloni, contiguo, sequenza) e' definito da un unico STS, la mappe con gli STS sono molto utili per identificare e combinare dati di mappatura ottenuti da differenti strategie. Per identificare tra le sequenze di DNA umano quelle corrispondenti a geni sono usati particolari STS, chiamati ESTs (Expressed Sequence Tags), ottenuti scrinando libraries di cDNA, che riconoscono sequenze trascritte. Infatti una applicazione degli ESTs include la localizzazione di geni lungo i cromosomi e l'identificazione di regioni codificanti nel genoma umano.

Se cerchi altro consulta
http://www.biologia.uniba.it/didattica/Tesine/Mappatura%20genetica-fisica.html

oppure cerca su un motore di ricerca "Sequence Tagged Site".

Scusate se di qualità questa volta il post è un pò scarso ma vado di fretta! Se trovo altro lo aggiungerò!

Ciao e a presto!

... e, mentre questo pianeta ha continuato a roteare seguendo le immutabili leggi di gravità, da un inizio così semplice infinite forme, sempre più belle e meravigliose, si sono evolute e tuttora si evolvono.
Charles Darwin
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maister46
Nuovo Arrivato



14 Messaggi

Inserito il - 22 febbraio 2012 : 14:15:52  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di maister46 Invia a maister46 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Qual'è la risoluzione media delle mappe STS?
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