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RobertaGraceConte
Nuovo Arrivato
7 Messaggi |
 Inserito il - 26 giugno 2012 : 12:05:31
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Salve a tutti :)
Sono una studentessa di Scienze Biologiche.
Sto studiando per l'esame di Biologia Molecolare e stamattina riflettevo su una cosa...magari sembrerà una domanda stupida, ma ero curiosa di sapere se il fattore sigma ha la capacità di interagire con le regioni -10 e -35 del promotore, è anche in grado di legarsi ad esse senza formare il complesso RNA-polimerasi Oloenzima? Cioè il fattore sigma libero in soluzione è in grado di legarsi, da solo, al promotore?
Ringrazio tutti per un'eventuale risposta 
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SpemannOrganizer
Utente
Città: Los Angeles
955 Messaggi |
Inserito il - 26 giugno 2012 : 12:58:36
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Se non ricordo male c'è un dominio che impedisce il legame del fattore sigma al DNA quando questo è da solo. L'interazione con la RNA pol fa cambiare conformazione a tale dominio e quindi il sigma si lega al DNA solo nel complesso oloenzima. Per sicurezza guardo sul lewin e ti faccio sapere in una futura risposta.
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SpemannOrganizer
Utente
Città: Los Angeles
955 Messaggi |
Inserito il - 26 giugno 2012 : 13:08:37
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sul lewin Genes IX trovo questo: (pag. 281)
"The N-terminal region of sigma70 has important regulatory functions. If it is removed, the shortened protein becomes able to bind specifically to promoter sequences. This suggests that the N-terminal region behaves as an autinhibition domain. It occludes the DNA-binding domains when sigma70 is free.Association with the core enzyme changes conformation of sigma so that the inhibition is released, and the DNA-binding domains can contact DNA."
insomma mi ricordavo bene  |
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RobertaGraceConte
Nuovo Arrivato
7 Messaggi |
Inserito il - 26 giugno 2012 : 14:39:37
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Perfetto!!! 
Grazie mille! Sei stato gentilissimo!!!  |
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SpemannOrganizer
Utente
Città: Los Angeles
955 Messaggi |
Inserito il - 26 giugno 2012 : 15:33:52
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| di nulla figurati ;) |
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GiordanoL
Nuovo Arrivato
23 Messaggi |
Inserito il - 15 dicembre 2015 : 10:20:59
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Qui E.Coli- E’ presente una sola Polimerasi che è in grado di riconoscere autonomamente la sequenza per l’inizio della trascrizione, il promotore.
Il promotore di E.Coli è composto da due subunità:
Regione -35
Regione -10
L’inizio della trascrizione corrisponde al momento in cui avviene l’assemblaggio del complesso di inizio della trascrizione. Nei batteri la Polimerasi si lega direttamente al promotore grazie alla subunità #948; (enzima core) che riconosce la regione -35 e fa attaccare la Polimerasi dalla regione -35 alla -10. Il complesso di inizio della trascrizione al momento è ”chiuso” e va reso aperto, ciò accade grazie alla collaborazione tra le subunità #948; e #946; che rompono l’appaiamento tra le basi intorno alla regione -10.
Qui Eucarioti- La trascrizione dei geni nucleari eucariotici richiede tre RNA Polimerasi:
RNA Polimerasi I: Trascrive unità ripetute in copie multiple dei geni per gli rRNA
RNA Polimerasi II: Trascrive geni che codificano proteine
RNA Polimerasi III: Trascrive tRNA
I promotori eucariotici sono più complessi, non c’è soltanto il promotore core ( sito al quale si lega il complesso) ci sono anche elementi promotori a monte. Ognuna delle tre Polimerasi riconosce sequenze diverse, la Polimerasi II riconosce due segmenti del core del promotore:
Regione -25/ Tata Box
Sequenza iniziatrice/ Nucleotide +1
Le Polimerasi eucariotiche non riconoscono le sequenze promotore core, per la Polimerasi II il contatto iniziale è stabilito da GTF ( fattore generale di trascrizione TFIID). GTF è composto da proteine che legame Tata box e 12 fattori associati. Il legame con Tata box genera una curvatura di 80°-90° nel DNA e si allarga il solco minore. A questo punto entra in gioco TFIIB che ha contatti con Tata box attraverso il solco minore allargato e lega il suo motivo di riconoscimento nel solco maggiore. Queste associazione generano il corretto posizionamento della Polimerasi. Il complesso però ancora non è attivo, per esserlo, necessità di una fosforilazione al dominio C-Terminale (CTD) della subunità più grande della Polimerasi II. |
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Discussione |
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Fattore sigma non legato a RNA-polimerasi
Didattica
