non so se ho ben capito la domanda...praticamente vuoi sapere se è possibile individuare di un doppio filamento quale è quello più recente? è possibile notarlo in base ad elementi che si associano al DNA impiegandoci del tempo ad esempio nei procarioti puoi distinguerlo guardando il profilo di metilazione dato che il nuovo filamento impiegherà del tempo per ricevere la nuova metilazione