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genoveffa
Nuovo Arrivato


Prov.: Avellino


25 Messaggi

Inserito il - 26 giugno 2006 : 19:29:50  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di genoveffa Invia a genoveffa un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao a tutti
volevo sapere se qualcuno può segnalarmi qualcosa sulle
orf.
grazie

dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi

Inserito il - 28 giugno 2006 : 16:22:16  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ti servono informazioni sulle ORF o su una ORF in particolare?

Nel primo caso, potresti partire banalmente dalla definizione di google:
http://www.google.it/search?hl=it&q=define%3A%22Open+reading+frame%22&btnG=Cerca&meta=lr%3Dlang_it
e poi girare un po' di wikipedie:
http://en.wikipedia.org/wiki/Open_reading_frame
http://www.biocrawler.com/encyclopedia/Open_reading_frame

Infine puoi provare qualche motore di ricerca piu' raffinato, tipo:
http://www.scirus.com/srsapp/search?q=%22open+reading+frame%22+NEAR+course&ds=nom&ds=web&g=s&t=all
http://clusty.com/search?input-form=simple-clusty&query=%22Open+reading+frame%22

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
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memole
Utente Junior

memole

Prov.: Brindisi
Città: brindisi


577 Messaggi

Inserito il - 30 giugno 2006 : 12:19:52  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di memole Invia a memole un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao detto in parole povere la orf o sequenza aperta di lettura è la regione presente sull'mRNA che codifica per la proteina. è caratterizzata dal codone ATG di inizio e da uno dei tre codoni di stop.questo davvero in sintesi...spero di esserti stata utile
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ales
Utente Junior

Prov.: Palermo
Città: Palermo


455 Messaggi

Inserito il - 23 maggio 2007 : 23:27:19  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di ales Invia a ales un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
il codone d'inizio ricordo ke è AUG

Ales
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Crick82
Utente Junior



139 Messaggi

Inserito il - 24 maggio 2007 : 01:45:32  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Crick82 Invia a Crick82 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Se si ricercano le ORF sul filamento senso del DNA si cercheranno gli ATG. Se invece si cerca di capire quale parte dell'mRNA rappresenta l'ORF, allora si cercherà l'AUG.
Anche le tabelle del codice genetico a volte riportano le T, quindi si riferiscono al DNA o al cDNA ed altre volte portano le U e quindi si riferiscono all'RNA.
Ci sono programmi appositi che immessa la sequenza, permettono di trovare le ORF nei vari frame possibili. In base alla dimensione dell'ORF già si intuisce quale dovrebbe essere l'ORF che effettivamente verrà poi tradotta in proteina.
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