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Faby.mt
Nuovo Arrivato
Prov.: Palermo
20 Messaggi |
 Inserito il - 05 novembre 2007 : 16:53:37
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Ciao raga ho bisogno dei chiarimenti per quanto riguarda gli impilamenti delle basi azotate e tutto ciò che ne consegue per formare la doppia elica.
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Faby |
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nyo84
Utente Junior
Prov.: Brescia
Città: Piancogno
239 Messaggi |
 Inserito il - 05 novembre 2007 : 18:00:57
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cosa vuoi sapere??
le basi azotate si legano a formare un legame fosfodiesterico tra il 3' OH del ribosio o del desossiribosio ( a secodna che sia DNA o RNA) e il 5' fosfato dell'altro nucleotide..la reazione avviene grazie alla polimerasi e prevede la liberazione di un pirofosfato dal nucleotide trifosfato che viene aggiunto...le due eliche che si appaiano sono antiparallele:una è in senso 3'->5' e una in senso 5'->3'..si legano mediante legami idrogeno tra che si formano tra basi complementari..A con T e c con G...man mano che si formano i ponti idrogeno, la "scala a pioli" tende ad avvolgersi su sè stessa assumendo la classica conformazione del DNA..
se vuoi sapere qualcosa di più,chiedi.. |
Fai attenzione quando leggi libri di medicina..potresti morire per un
errore di stampa... |
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Dionysos
Moderatore
Città: Heidelberg
1913 Messaggi |
Inserito il - 05 novembre 2007 : 20:59:36
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L'impilamento è un tipo di interazione debole tra le strutture
aromatiche delle basi azotate consecutive, e consiste sostanzialmente
in una interazione di tipo idrofobico, dovuto alla forte differenza di
idrosolubilità tra i fosfati, che sono 'esterni' all'elica (in quanto
interagiscono con il solvente acquoso) e le strutture poliaromatiche
poco polari 'interne' all'elica.
L'impilamento ha un ruolo molto importante nella stabilizzazione
della struttura a doppia elica, credo addirittura al pari dei
ponti idrogeno tra le basi (in mancanza dei quali si hanno
destabilizzazioni e rigonfiamenti, come nei mismatch appunto).
Credo, ma non sono certo, che nelle interazione tra le strutture
aromatiche possano giocare un ruolo eventuali interazioni tra
gli orbitali delocalizzati "aromatici", che non raramente
tendono a intrattenere coniugazioni importanti.
Su quest'ultima cosa non posso però garantirti nulla
(anzi, qualora tu riuscissi ad approfondirla, interesserebbe anche a me!) |
Volere libera : questa é la vera dottrina della volontà e della libertà
(F.W. Nietzsche)
Less Jim Morrison, more Sean Morrison!
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Faby.mt
Nuovo Arrivato
Prov.: Palermo
20 Messaggi |
Inserito il - 05 novembre 2007 : 22:07:21
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| piu o meno qst l'ho capito...quello che nn ho chiaro sono le forze di stacking, propellr twist... |
Faby |
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Balsamo del Canadà
Nuovo Arrivato
Prov.: Verbano-Cusio-Ossola
Città: Verbania
97 Messaggi |
Inserito il - 06 novembre 2007 : 11:11:33
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Lo stacking tra le basi è dovuto semplicemente al fatto che è la conformazione più stabile che non permetta al solvente di infilarsi tra le basi generando una dissociazione dei filamenti. Inoltre è garantita mi sembra dalla interazione verticale tra le coppie di basi. L'EtBr infatti quando si intercala permette lo svolgimento dell'elica perchè da una parte "tappa" le fessure che potrebero essere accessibili al solvente ed inoltre (mi sembra di ricordare) fa interazioni di impilamento con le coppie di basi attigue.
Il propeller twist più che una forza mi sembra sia uno dei muovimenti permessi tra le coppie di basi. |
-B.del C.- |
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acidi
Didattica
