il problema del superavvolgimento č risolto dall'azione delle topoisomerasi. enzimi che introducono superavvolgimenti negativi nel DNA o convertono DNA superavvolto negativamente in DNA rilassato. Le topoisomerasi svolgono un ruolo importante nel processo replicativo, impedendo che si formi DNA eccessivamente avvolto e permettendo ad entrambe le eliche parentali di rimanere intatte durante il ciclo replicativo, mentre la forca replicativa procede. la parte non replicata della struttura theta davanti alla forca replicativa subisce l'introduzione di ripetuti superavvolgimenti negativi da parte di DNA girasi, topoisomerasi di tipo 2, che rimuovono i superavvolgimenti positivi dovuti allo svolgimento del DNA durante la replicazione.