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zerhos
Utente Junior
Prov.: Pisa
Città: Pisa
421 Messaggi |
 Inserito il - 21 giugno 2009 : 20:37:47
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ho un dubbio sulla chip
una volta che abbiamo purificato il frammento di DNA possiamo analizzarlo tramite PCR-quantitativa o ibridazione su chip
-la PCR giustamente la possiamo usare quando conosciamo(o ipotizziamo) quale sia la sequenza consenso a cui si lega il TF
-quando non lo conosciamo facciamo una chip on chip,ma non credo che la quantità di cromatina precipitata e purificata sia sufficiente per farla ibridare,dovremmo amplificarla....
cosa facciamo?mettiamo dei tag al 5' e al 3' e amplifichiamo per PCR,
ma come?. Questo punto mi rimane oscuro,aiutatemi a fare luce,grazie.
ne approfitto anche per fare questa domanda sul microarray:
i chip dell affymetrix presentano per ogni "feature" un tot di oligo tutti uguali per permettere l'ibridazione e una stessa quantità di oligo differenti solo per una base.questi ultimi servono come misurazione dell'ibridazione aspecifica di fondo......
penso proprio di non comprendere bene questa cosa...
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"l'unica differenza tra me e un pazzo è che io non sono pazzo!"
Salvador.Dalì
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ChIP on chip e amplificazione
Didattica
