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mr.madmax85
Nuovo Arrivato

2 Messaggi

Inserito il - 23 giugno 2009 : 11:20:22

Buongiorno a tutti!

Qualcuno pu� illuminarmi sul pair ends sequencing e sul BAC-by-BAC sequencing......non ne vengo fuori..

mr.madmax85
Nuovo Arrivato

2 Messaggi

Inserito il - 30 giugno 2009 : 11:36:29

Niente....?

Cio�, il pair ends si utilizza generalmente nel shotgun sequencing nel momento in cui bisogna allineare i vari contigs e ci si trova davanti il problema delle lunghe sequenze ripetute. Il pair ends, da quello che ho capito, consiste nel sequenziare le estremit� di alcuni inserti per usarle come reference in fase di allineamento...quello che non capisco � come...voglio dire, non � la stessa cosa usare un qualsiasi altro contig overlappante?

Patrizio
Moderatore

Citt�: Barcellona

1914 Messaggi

Inserito il - 30 giugno 2009 : 23:50:55

� al contrario ,lo shutgun ti permette di avere dei cluster e ovviamente anche dei buchi che vengono chiusi con altri sistemi
se cerchi nel forum ci sono molte discussioni a riguardo
diversamente per i contig by BAC ,in cui sequenzi l'intero BAC una volta trovati i contigui
sono due metodi diversi che hanno differenti vantaggi e svantaggi